Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G058800.1
Synonym Sb10g005075
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YHK6
Pfam PF04195
Panther DB PTHR31099
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51172 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049841
Brachypodium KQK19292
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G058800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G154600 expressed protein -
2 Sobic.002G023600 BED zinc finger family protein, expressed -
3 Sobic.010G173000 expressed protein -
4 Sobic.004G253601 - -
5 Sobic.007G130300 ES43 protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G105000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G244700 cytosolic phospholipase A2 beta, putative, expressed K19219: peptidyl-lysine (3S)-dioxygenase / protease
9 Sobic.005G122900 - -
10 Sobic.002G316500 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G380000 TRM112, putative, expressed K15448: TRM112, multifunctional methyltransferase subunit TRM112
12 Sobic.006G208800 YT521-B, putative, expressed -
13 Sobic.003G024800 CGMC_GSK.2 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K14502: protein brassinosteroid insensitive 2
14 Sobic.010G228600 LSM domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G136000 DnaK family protein, putative, expressed K03283: heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
16 Sobic.004G083200 targeting protein for Xklp2, putative, expressed -
17 Sobic.010G046400 glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase, putative, expressed -
18 Sobic.003G311200 - -
19 Sobic.002G014700 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G131700 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G058800 Sobic010G058800 Sobic006G154600 Sobic006G154600 Sobic010G058800--Sobic006G154600 Sobic002G023600 Sobic002G023600 Sobic010G058800--Sobic002G023600 Sobic010G173000 Sobic010G173000 Sobic010G058800--Sobic010G173000 Sobic004G253601 Sobic004G253601 Sobic010G058800--Sobic004G253601 Sobic007G130300 Sobic007G130300 Sobic010G058800--Sobic007G130300 Sobic002G105000 Sobic002G105000 Sobic010G058800--Sobic002G105000 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic010G058800--Sobic004G204400 Sobic002G244700 Sobic002G244700 Sobic010G058800--Sobic002G244700 Sobic005G122900 Sobic005G122900 Sobic010G058800--Sobic005G122900 Sobic006G154600--Sobic010G058800 Sobic004G064900 Sobic004G064900 Sobic006G154600--Sobic004G064900 Sobic003G140000 Sobic003G140000 Sobic006G154600--Sobic003G140000 Sobic006G208800 Sobic006G208800 Sobic006G154600--Sobic006G208800 Sobic002G022400 Sobic002G022400 Sobic006G154600--Sobic002G022400 Sobic004G133500 Sobic004G133500 Sobic006G154600--Sobic004G133500 Sobic002G136600 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Octagon: transcription factors


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