Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G028800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q8W6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G130800 PB1 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G221250 - -
3 Sobic.002G428501 - -
4 Sobic.009G067600 - -
5 Sobic.002G190200 ZOS9-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.006G061900 AT hook motif domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G087900 non-lysosomal glucosylceramidase, putative, expressed K17108: non-lysosomal glucosylceramidase
8 Sobic.001G521500 callose synthase-like enzyme(PubMedID : 25311645)@1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
9 Sobic.002G229600 - -
10 Sobic.005G182000 - -
11 Sobic.004G003600 - -
12 Sobic.005G103200 - -
13 Sobic.004G017000 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G037150 - -
15 Sobic.001G462500 natural resistance-associated macrophage protein, putative, expressed K12347: SLC11A1, natural resistance-associated macrophage protein 1
16 Sobic.009G058200 - -
17 Sobic.007G220000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@C3-BTB2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with C3 subfamily conserved sequence, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.004G175400 - -
19 Sobic.009G139000 - -
20 Sobic.005G150350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G028800 Sobic002G028800 Sobic001G130800 Sobic001G130800 Sobic002G028800--Sobic001G130800 Sobic005G221250 Sobic005G221250 Sobic002G028800--Sobic005G221250 Sobic002G428501 Sobic002G428501 Sobic002G028800--Sobic002G428501 Sobic009G067600 Sobic009G067600 Sobic002G028800--Sobic009G067600 Sobic002G190200 Sobic002G190200 Sobic002G028800--Sobic002G190200 Sobic006G061900 Sobic006G061900 Sobic002G028800--Sobic006G061900 Sobic005G087900 Sobic005G087900 Sobic002G028800--Sobic005G087900 Sobic001G521500 Sobic001G521500 Sobic002G028800--Sobic001G521500 Sobic002G229600 Sobic002G229600 Sobic002G028800--Sobic002G229600 Sobic001G130800--Sobic002G428501 Sobic002G071350 Sobic002G071350 Sobic001G130800--Sobic002G071350 Sobic010G126200 Sobic010G126200 Sobic001G130800--Sobic010G126200 Sobic007G043100 Sobic007G043100 Sobic001G130800--Sobic007G043100 Sobic001G130800--Sobic002G190200 Sobic001G283900 Sobic001G283900 Sobic001G130800--Sobic001G283900 Sobic008G187632 Sobic008G187632 Sobic005G221250--Sobic008G187632 Sobic005G150350 Sobic005G150350 Sobic005G221250--Sobic005G150350 Sobic010G262500 Sobic010G262500 Sobic005G221250--Sobic010G262500 Sobic001G298700 Sobic001G298700 Sobic005G221250--Sobic001G298700 Sobic009G139000 Sobic009G139000 Sobic005G221250--Sobic009G139000 Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic005G221250--Sobic005G182000 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic005G221250--Sobic009G161550 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic005G221250--Sobic003G160100 Sobic003G061200 Sobic003G061200 Sobic005G221250--Sobic003G061200 Sobic002G428501--Sobic001G130800 Sobic002G428501--Sobic002G071350 Sobic002G428501--Sobic010G126200 Sobic002G428501--Sobic007G043100 Sobic002G428501--Sobic002G190200 Sobic002G428501--Sobic001G283900 Sobic006G125400 Sobic006G125400 Sobic009G067600--Sobic006G125400 Sobic009G197700 Sobic009G197700 Sobic009G067600--Sobic009G197700 Sobic006G146100 Sobic006G146100 Sobic009G067600--Sobic006G146100 Sobic007G060000 Sobic007G060000 Sobic009G067600--Sobic007G060000 Sobic001G235500 Sobic001G235500 Sobic009G067600--Sobic001G235500 Sobic009G067600--Sobic002G028800 SobicK008450 SobicK008450 Sobic009G067600--SobicK008450 Sobic002G148000 Sobic002G148000 Sobic009G067600--Sobic002G148000 Sobic007G220000 Sobic007G220000 Sobic009G067600--Sobic007G220000 Sobic002G190200--Sobic002G071350 Sobic002G190200--Sobic010G126200 Sobic002G190200--Sobic002G428501 Sobic002G190200--Sobic007G043100 Sobic002G059932 Sobic002G059932 Sobic002G190200--Sobic002G059932 Sobic002G190200--Sobic001G283900 Sobic006G061900--Sobic005G221250 Sobic003G069875 Sobic003G069875 Sobic006G061900--Sobic003G069875 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic006G061900--Sobic004G038800 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic006G061900--Sobic001G333300 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic006G061900--Sobic007G010700 Sobic003G317500 Sobic003G317500 Sobic006G061900--Sobic003G317500 Sobic005G095660 Sobic005G095660 Sobic006G061900--Sobic005G095660 Sobic006G061900--Sobic005G150350 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic006G061900--Sobic001G459600 Sobic001G251200 Sobic001G251200 Sobic005G087900--Sobic001G251200 Sobic003G036600 Sobic003G036600 Sobic005G087900--Sobic003G036600 Sobic005G087900--Sobic001G521500 Sobic001G128300 Sobic001G128300 Sobic005G087900--Sobic001G128300 Sobic005G087900--Sobic002G229600 Sobic003G298600 Sobic003G298600 Sobic005G087900--Sobic003G298600 Sobic007G056600 Sobic007G056600 Sobic005G087900--Sobic007G056600 Sobic003G362600 Sobic003G362600 Sobic005G087900--Sobic003G362600 Sobic001G399800 Sobic001G399800 Sobic005G087900--Sobic001G399800 Sobic009G122325 Sobic009G122325 Sobic001G521500--Sobic009G122325 Sobic003G252400 Sobic003G252400 Sobic001G521500--Sobic003G252400 Sobic001G521500--Sobic003G036600 Sobic001G521500--Sobic005G087900 Sobic003G397500 Sobic003G397500 Sobic001G521500--Sobic003G397500 Sobic003G229000 Sobic003G229000 Sobic001G521500--Sobic003G229000 Sobic006G115300 Sobic006G115300 Sobic001G521500--Sobic006G115300 Sobic009G136100 Sobic009G136100 Sobic001G521500--Sobic009G136100 Sobic001G521500--Sobic002G229600 Sobic002G229600--Sobic003G252400 Sobic004G211301 Sobic004G211301 Sobic002G229600--Sobic004G211301 Sobic002G013900 Sobic002G013900 Sobic002G229600--Sobic002G013900 Sobic002G229600--Sobic003G397500 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic002G229600--Sobic003G066900 Sobic004G257350 Sobic004G257350 Sobic002G229600--Sobic004G257350 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic002G229600--Sobic003G233900 Sobic002G331450 Sobic002G331450 Sobic002G229600--Sobic002G331450 Sobic002G189000 Sobic002G189000 Sobic002G229600--Sobic002G189000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.