Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G033500.1
Synonym Sb02g002910
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X9I2
Pfam PF04078
Panther DB PTHR12262 PTHR12262:SF0
NCBI CDD KOG3036; Protein involved in cell differentiation/sexual development
KEGG Orthology K12606; RCD1, CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9
Gene Ontology GO:0006402; mRNA catabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G20800 : Cell differentiation, Rcd1-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g57130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK21031 , KQK21041 , KQK21042
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G033500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G239900 ketol-acid reductoisomerase, chloroplast precursor, putative, expressed K00053: ketol-acid reductoisomerase
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16 Sobic.003G103100 - -
17 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic002G033500 Sobic002G033500 Sobic009G239900 Sobic009G239900 Sobic002G033500--Sobic009G239900 Sobic006G046300 Sobic006G046300 Sobic002G033500--Sobic006G046300 Sobic006G061100 Sobic006G061100 Sobic002G033500--Sobic006G061100 Sobic010G044900 Sobic010G044900 Sobic002G033500--Sobic010G044900 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic002G033500--Sobic002G286800 Sobic007G095700 Sobic007G095700 Sobic002G033500--Sobic007G095700 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic002G033500--Sobic002G273000 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic002G033500--Sobic005G124400 Sobic003G027350 Sobic003G027350 Sobic002G033500--Sobic003G027350 Sobic009G239900--Sobic002G033500 Sobic009G239900--Sobic006G046300 Sobic009G239900--Sobic006G061100 Sobic004G210000 Sobic004G210000 Sobic009G239900--Sobic004G210000 Sobic007G042300 Sobic007G042300 Sobic009G239900--Sobic007G042300 Sobic001G305100 Sobic001G305100 Sobic009G239900--Sobic001G305100 Sobic009G239900--Sobic003G027350 Sobic005G074400 Sobic005G074400 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Octagon: transcription factors


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