Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G239900.1
Synonym Sb09g029170
Functional annotation ketol-acid reductoisomerase, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt C5YW13
Pfam PF07991 PF01450
Panther DB PTHR21371 PTHR21371:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00053; ketol-acid reductoisomerase
Gene Ontology GO:0009082; branched-chain amino acid biosynthetic process GO:0004455ketol-acid reductoisomerase activity GO:0016491oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G58610 : ketol-acid reductoisomerase
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49800.1 : ketol-acid reductoisomerase, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027770 , Zm00025a028229 , Zm00025a036667
Brachypodium KQK04757
Barley HORVU1Hr1G090490.11 , HORVU1Hr1G090490.10 , HORVU1Hr1G090490.13 , HORVU1Hr1G090490.12 , HORVU1Hr1G090490.15 , HORVU1Hr1G090490.14 , HORVU1Hr1G090490.17 , HORVU1Hr1G090490.16 , HORVU1Hr1G090490.9 , HORVU1Hr1G090490.8 , HORVU1Hr1G090490.5 , HORVU1Hr1G090490.4 , HORVU1Hr1G090490.7 , HORVU1Hr1G090490.6 , HORVU1Hr1G090490.1 , HORVU1Hr1G090490.3 , HORVU1Hr1G090490.2
Wheat TraesCS1B02G442300 , TraesCS1D02G419800 , TraesCS1D02G419800 , TraesCS1A02G411900
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cDNA sequences
Sobic.009G239900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G239900 Sobic009G239900 Sobic002G033500 Sobic002G033500 Sobic009G239900--Sobic002G033500 Sobic006G046300 Sobic006G046300 Sobic009G239900--Sobic006G046300 Sobic006G061100 Sobic006G061100 Sobic009G239900--Sobic006G061100 Sobic004G210000 Sobic004G210000 Sobic009G239900--Sobic004G210000 Sobic007G042300 Sobic007G042300 Sobic009G239900--Sobic007G042300 Sobic001G305100 Sobic001G305100 Sobic009G239900--Sobic001G305100 Sobic003G027350 Sobic003G027350 Sobic009G239900--Sobic003G027350 Sobic005G074400 Sobic005G074400 Sobic009G239900--Sobic005G074400 Sobic006G161300 Sobic006G161300 Sobic009G239900--Sobic006G161300 Sobic002G033500--Sobic009G239900 Sobic002G033500--Sobic006G046300 Sobic002G033500--Sobic006G061100 Sobic010G044900 Sobic010G044900 Sobic002G033500--Sobic010G044900 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic002G033500--Sobic002G286800 Sobic007G095700 Sobic007G095700 Sobic002G033500--Sobic007G095700 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic002G033500--Sobic002G273000 Sobic005G124400 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Octagon: transcription factors


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