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Transcriptome id Sobic.002G092901.1
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UniProt A0A1W0W327
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G061000 DNA binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G015200 NAP1, putative, expressed K05750: NCKAP1, NCK-associated protein 1
3 Sobic.003G006900 microtubule associated protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G167100 TBC domain containing protein, expressed -
5 Sobic.010G067600 expressed protein K16586: HAUS augmin-like complex subunit 3
6 Sobic.002G276600 endoglucanase, putative, expressed -
7 Sobic.009G073400 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G537300 Class III HD ZIP family protein(PubMedID : 23915383)@START domain containing protein, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
9 Sobic.005G017000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G410700 exostosin family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G420300 zinc finger protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G179300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G252700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cullin family domain containing protein, putative, expressed K03349: anaphase-promoting complex subunit 2
14 Sobic.010G250800 DNA binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G052100 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K10389: tubulin gamma
16 Sobic.001G159800 KIP1, putative, expressed -
17 Sobic.001G119800 expressed protein -
18 Sobic.002G374400 -(PubMedID : 23108465)@"DEP2(Ortholog in rice:Li et al., 2010)"(PubMedID : 31659864)@expressed protein -
19 Sobic.008G192700 ATMAP70 protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G252500 1,3-beta-glucan synthase component, putative, expressed K11000: callose synthase


Gene co-expression network
sample Sobic002G092901 Sobic002G092901 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic002G092901--Sobic009G061000 Sobic008G015200 Sobic008G015200 Sobic002G092901--Sobic008G015200 Sobic003G006900 Sobic003G006900 Sobic002G092901--Sobic003G006900 Sobic009G167100 Sobic009G167100 Sobic002G092901--Sobic009G167100 Sobic010G067600 Sobic010G067600 Sobic002G092901--Sobic010G067600 Sobic002G276600 Sobic002G276600 Sobic002G092901--Sobic002G276600 Sobic009G073400 Sobic009G073400 Sobic002G092901--Sobic009G073400 Sobic001G537300 Sobic001G537300 Sobic002G092901--Sobic001G537300 Sobic005G017000 Sobic005G017000 Sobic002G092901--Sobic005G017000 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic009G061000--Sobic006G267500 Sobic009G061000--Sobic009G073400 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic009G061000--Sobic001G437500 Sobic009G061000--Sobic002G276600 Sobic001G159800 Sobic001G159800 Sobic009G061000--Sobic001G159800 Sobic010G090500 Sobic010G090500 Sobic009G061000--Sobic010G090500 Sobic009G206500 Sobic009G206500 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Octagon: transcription factors


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