Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G096300.1
Synonym
Functional annotation kinase, pfkB family, putative, expressed
UniProt C5X2Q8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g09370.3 : kinase, pfkB family, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016412
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G189432 - -
2 Sobic.010G089600 Up-regulation in phyB-1 mutant(PubMedID : 26893475)@trehalose phosphatase, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
3 Sobic.009G119600 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
4 Sobic.004G253200 amino acid transporter, putative, expressed K14207: SLC38A2, solute carrier family 38 (sodium-coupled neutral amino acid transporter), member 2
5 Sobic.003G187700 polygalacturonase, putative, expressed -
6 Sobic.001G342101 - -
7 Sobic.008G055600 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G184101 - -
9 Sobic.001G213666 - -
10 Sobic.009G087100 cyclin-A1, putative, expressed K06627: cyclin-A
11 Sobic.003G348100 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G400000 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed K12448: UXE, UDP-arabinose 4-epimerase
13 Sobic.006G256000 - -
14 Sobic.008G023300 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
15 Sobic.007G127500 - -
16 Sobic.004G035400 PFT1, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
17 Sobic.004G007400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G012700 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
19 Sobic.003G244400 OsFBK1 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -
20 Sobic.001G502100 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter


Gene co-expression network
sample Sobic002G096300 Sobic002G096300 Sobic010G189432 Sobic010G189432 Sobic002G096300--Sobic010G189432 Sobic010G089600 Sobic010G089600 Sobic002G096300--Sobic010G089600 Sobic009G119600 Sobic009G119600 Sobic002G096300--Sobic009G119600 Sobic004G253200 Sobic004G253200 Sobic002G096300--Sobic004G253200 Sobic003G187700 Sobic003G187700 Sobic002G096300--Sobic003G187700 Sobic001G342101 Sobic001G342101 Sobic002G096300--Sobic001G342101 Sobic008G055600 Sobic008G055600 Sobic002G096300--Sobic008G055600 Sobic004G184101 Sobic004G184101 Sobic002G096300--Sobic004G184101 Sobic001G213666 Sobic001G213666 Sobic002G096300--Sobic001G213666 Sobic010G189432--Sobic004G253200 Sobic010G189432--Sobic008G055600 Sobic010G189432--Sobic003G187700 Sobic010G189432--Sobic009G119600 Sobic010G189432--Sobic001G213666 Sobic010G189432--Sobic001G342101 Sobic004G120500 Sobic004G120500 Sobic010G189432--Sobic004G120500 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic010G189432--Sobic001G400000 Sobic009G087100 Sobic009G087100 Sobic010G189432--Sobic009G087100 Sobic008G023300 Sobic008G023300 Sobic010G089600--Sobic008G023300 Sobic004G035400 Sobic004G035400 Sobic010G089600--Sobic004G035400 Sobic007G127500 Sobic007G127500 Sobic010G089600--Sobic007G127500 Sobic010G089600--Sobic003G187700 Sobic010G089600--Sobic010G189432 Sobic010G089600--Sobic001G213666 Sobic010G089600--Sobic004G253200 Sobic007G127550 Sobic007G127550 Sobic010G089600--Sobic007G127550 Sobic010G089600--Sobic004G184101 Sobic009G119600--Sobic004G253200 Sobic009G119600--Sobic008G055600 Sobic009G119600--Sobic010G189432 Sobic009G119600--Sobic003G187700 Sobic003G013900 Sobic003G013900 Sobic009G119600--Sobic003G013900 Sobic001G279000 Sobic001G279000 Sobic009G119600--Sobic001G279000 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic009G119600--Sobic005G144000 Sobic002G170100 Sobic002G170100 Sobic009G119600--Sobic002G170100 Sobic003G244400 Sobic003G244400 Sobic009G119600--Sobic003G244400 Sobic004G253200--Sobic008G055600 Sobic004G253200--Sobic003G187700 Sobic004G253200--Sobic009G119600 Sobic004G253200--Sobic010G189432 Sobic004G253200--Sobic004G120500 Sobic004G253200--Sobic001G342101 Sobic004G253200--Sobic005G144000 Sobic004G253200--Sobic001G213666 Sobic004G253200--Sobic001G279000 Sobic003G187700--Sobic004G253200 Sobic003G187700--Sobic008G055600 Sobic003G187700--Sobic010G189432 Sobic003G187700--Sobic001G342101 Sobic003G187700--Sobic009G119600 Sobic003G187700--Sobic001G213666 Sobic003G187700--Sobic005G144000 Sobic003G187700--Sobic004G120500 Sobic003G187700--Sobic001G279000 Sobic001G342101--Sobic008G055600 Sobic001G342101--Sobic005G144000 Sobic001G342101--Sobic003G187700 Sobic001G342101--Sobic004G253200 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic001G342101--Sobic003G441000 Sobic001G342101--Sobic001G279000 Sobic001G342101--Sobic010G189432 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic001G342101--Sobic005G050400 Sobic001G342101--Sobic001G400000 Sobic008G055600--Sobic004G253200 Sobic008G055600--Sobic001G279000 Sobic008G055600--Sobic005G144000 Sobic008G055600--Sobic009G119600 Sobic008G055600--Sobic001G342101 Sobic008G055600--Sobic003G187700 Sobic008G055600--Sobic003G244400 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic008G055600--Sobic004G358000 Sobic008G055600--Sobic003G441000 Sobic004G184101--Sobic007G127550 Sobic004G184101--Sobic008G023300 Sobic004G184101--Sobic010G089600 Sobic004G184101--Sobic003G187700 Sobic004G184101--Sobic010G189432 Sobic002G381400 Sobic002G381400 Sobic004G184101--Sobic002G381400 Sobic004G184101--Sobic002G096300 Sobic004G184101--Sobic001G213666 Sobic004G184101--Sobic007G127500 Sobic001G213666--Sobic003G187700 Sobic001G213666--Sobic004G253200 Sobic001G213666--Sobic010G189432 Sobic001G213666--Sobic008G055600 Sobic001G213666--Sobic001G342101 Sobic006G256000 Sobic006G256000 Sobic001G213666--Sobic006G256000 Sobic001G213666--Sobic004G120500 Sobic001G213666--Sobic009G119600 Sobic001G213666--Sobic001G400000
Octagon: transcription factors


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