Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G108200.1
Synonym Sb02g009200
Functional annotation OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt C5X3M3
Pfam PF00646 PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF107
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28410 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g37110.1 : OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045609
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G407400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G108200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G134501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G108200 Sobic002G108200 Sobic007G199300 Sobic007G199300 Sobic002G108200--Sobic007G199300 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic002G108200--Sobic005G221550 Sobic007G070500 Sobic007G070500 Sobic002G108200--Sobic007G070500 Sobic005G170700 Sobic005G170700 Sobic002G108200--Sobic005G170700 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic002G108200--Sobic002G019750 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic002G108200--Sobic008G106400 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic002G108200--Sobic005G079700 Sobic010G153000 Sobic010G153000 Sobic002G108200--Sobic010G153000 Sobic007G064250 Sobic007G064250 Sobic002G108200--Sobic007G064250 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic007G199300--Sobic005G127300 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic007G199300--Sobic002G059800 Sobic007G199300--Sobic002G108200 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic007G199300--Sobic004G204400 Sobic007G199300--Sobic008G106400 Sobic007G199300--Sobic005G221550 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic007G199300--Sobic002G431200 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic007G199300--Sobic009G121750 Sobic007G199300--Sobic005G079700 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic007G070500--Sobic003G385000 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic007G070500--Sobic001G489150 Sobic007G070500--Sobic002G019750 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic007G070500--Sobic006G199700 Sobic001G284400 Sobic001G284400 Sobic007G070500--Sobic001G284400 Sobic010G266800 Sobic010G266800 Sobic007G070500--Sobic010G266800 Sobic003G043800 Sobic003G043800 Sobic007G070500--Sobic003G043800 Sobic010G116700 Sobic010G116700 Sobic007G070500--Sobic010G116700 Sobic006G219900 Sobic006G219900 Sobic007G070500--Sobic006G219900 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic005G170700--Sobic003G429500 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic005G170700--Sobic001G261480 Sobic005G170700--Sobic008G045600 Sobic005G170700--Sobic005G221550 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic005G170700--Sobic007G005000 Sobic005G170700--Sobic008G106400 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic005G170700--Sobic003G266700 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G170700--Sobic003G366850 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G170700--Sobic008G065400 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic002G019750--Sobic002G019500 Sobic002G019750--Sobic007G070500 Sobic002G019750--Sobic001G489150 Sobic002G019750--Sobic006G199700 Sobic006G223800 Sobic006G223800 Sobic002G019750--Sobic006G223800 Sobic008G155600 Sobic008G155600 Sobic002G019750--Sobic008G155600 Sobic002G019750--Sobic005G170700 Sobic002G106000 Sobic002G106000 Sobic002G019750--Sobic002G106000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic002G019750--Sobic005G064700 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic006G262700 Sobic006G262700 Sobic010G153000--Sobic006G262700 Sobic007G118075 Sobic007G118075 Sobic010G153000--Sobic007G118075 Sobic002G011100 Sobic002G011100 Sobic010G153000--Sobic002G011100 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic010G153000--Sobic009G116400 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic010G153000--Sobic005G154700 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic010G153000--Sobic004G089500 Sobic001G204700 Sobic001G204700 Sobic010G153000--Sobic001G204700 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic010G153000--Sobic003G397100 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic010G153000--Sobic006G028700 Sobic007G064250--Sobic008G065400 Sobic007G064250--Sobic008G106400 Sobic008G052500 Sobic008G052500 Sobic007G064250--Sobic008G052500 Sobic007G064250--Sobic003G266700 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic007G064250--Sobic010G101700 Sobic006G152400 Sobic006G152400 Sobic007G064250--Sobic006G152400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic007G064250--Sobic001G278600 Sobic007G064250--Sobic007G005000 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic007G064250--Sobic001G184500
Octagon: transcription factors


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