Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G209900.1
Synonym ZFP4, Sb02g025390
Functional annotation ZOS9-12 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5XDJ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G57520 : zinc finger protein 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g26210.1 : ZOS9-12 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047103 , Zm00025a013949
Brachypodium KQJ90343
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G069200 transferase family protein, putative, expressed K13065: E2.3.1.133, shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase
2 Sobic.005G084000 expressed protein -
3 Sobic.009G083300 white-brown complex homolog protein 12, putative, expressed -
4 Sobic.006G158500 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed K15095: (+)-neomenthol dehydrogenase
5 Sobic.005G020700 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
6 Sobic.004G143400 - -
7 Sobic.007G210600 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G118500 - -
9 Sobic.003G114100 expressed protein -
10 Sobic.007G059500 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
11 Sobic.004G006100 cytochrome P450, putative, expressed -
12 Sobic.004G044000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@EMB1303, putative, expressed -
13 Sobic.005G141000 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G120500 transmembrane protein 136, putative, expressed -
15 Sobic.008G117800 OsGrx_C12 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
16 Sobic.002G242600 expressed protein -
17 Sobic.001G221300 alcohol oxidase, putative, expressed K17756: long-chain-alcohol oxidase
18 Sobic.006G060700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@basic proline-rich protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G218400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G131700 PsbP, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G209900 Sobic002G209900 Sobic003G069200 Sobic003G069200 Sobic002G209900--Sobic003G069200 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic002G209900--Sobic005G084000 Sobic009G083300 Sobic009G083300 Sobic002G209900--Sobic009G083300 Sobic006G158500 Sobic006G158500 Sobic002G209900--Sobic006G158500 Sobic005G020700 Sobic005G020700 Sobic002G209900--Sobic005G020700 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic002G209900--Sobic004G143400 Sobic007G210600 Sobic007G210600 Sobic002G209900--Sobic007G210600 Sobic001G118500 Sobic001G118500 Sobic002G209900--Sobic001G118500 Sobic003G114100 Sobic003G114100 Sobic002G209900--Sobic003G114100 Sobic001G221300 Sobic001G221300 Sobic003G069200--Sobic001G221300 Sobic003G120500 Sobic003G120500 Sobic003G069200--Sobic003G120500 Sobic004G036100 Sobic004G036100 Sobic003G069200--Sobic004G036100 Sobic006G155700 Sobic006G155700 Sobic003G069200--Sobic006G155700 Sobic006G248200 Sobic006G248200 Sobic003G069200--Sobic006G248200 Sobic003G150600 Sobic003G150600 Sobic003G069200--Sobic003G150600 Sobic003G386300 Sobic003G386300 Sobic003G069200--Sobic003G386300 Sobic003G157400 Sobic003G157400 Sobic003G069200--Sobic003G157400 Sobic001G475600 Sobic001G475600 Sobic003G069200--Sobic001G475600 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic005G084000--Sobic001G495300 Sobic005G084000--Sobic007G210600 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic005G084000--Sobic008G131700 Sobic001G142400 Sobic001G142400 Sobic005G084000--Sobic001G142400 Sobic003G074700 Sobic003G074700 Sobic005G084000--Sobic003G074700 Sobic005G084000--Sobic004G143400 Sobic005G084000--Sobic009G083300 Sobic007G201400 Sobic007G201400 Sobic005G084000--Sobic007G201400 Sobic005G084000--Sobic003G069200 Sobic009G083300--Sobic003G069200 Sobic008G008500 Sobic008G008500 Sobic009G083300--Sobic008G008500 Sobic009G083300--Sobic006G155700 Sobic004G015700 Sobic004G015700 Sobic009G083300--Sobic004G015700 Sobic002G064400 Sobic002G064400 Sobic009G083300--Sobic002G064400 Sobic009G083300--Sobic005G084000 Sobic003G071600 Sobic003G071600 Sobic009G083300--Sobic003G071600 Sobic009G083300--Sobic001G142400 Sobic001G099000 Sobic001G099000 Sobic009G083300--Sobic001G099000 Sobic006G158500--Sobic005G084000 Sobic007G123200 Sobic007G123200 Sobic006G158500--Sobic007G123200 Sobic010G006400 Sobic010G006400 Sobic006G158500--Sobic010G006400 Sobic001G358900 Sobic001G358900 Sobic006G158500--Sobic001G358900 Sobic006G158500--Sobic004G143400 Sobic005G203600 Sobic005G203600 Sobic006G158500--Sobic005G203600 Sobic008G117800 Sobic008G117800 Sobic006G158500--Sobic008G117800 Sobic006G158500--Sobic008G008500 Sobic006G158500--Sobic001G142400 Sobic001G448600 Sobic001G448600 Sobic005G020700--Sobic001G448600 Sobic004G255500 Sobic004G255500 Sobic005G020700--Sobic004G255500 Sobic009G131800 Sobic009G131800 Sobic005G020700--Sobic009G131800 Sobic009G238300 Sobic009G238300 Sobic005G020700--Sobic009G238300 Sobic001G281500 Sobic001G281500 Sobic005G020700--Sobic001G281500 Sobic002G181132 Sobic002G181132 Sobic005G020700--Sobic002G181132 Sobic001G337600 Sobic001G337600 Sobic005G020700--Sobic001G337600 Sobic004G309400 Sobic004G309400 Sobic005G020700--Sobic004G309400 Sobic004G301200 Sobic004G301200 Sobic005G020700--Sobic004G301200 Sobic004G143400--Sobic005G084000 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic004G143400--Sobic001G269300 Sobic004G143400--Sobic007G210600 Sobic004G143400--Sobic001G495300 Sobic004G151900 Sobic004G151900 Sobic004G143400--Sobic004G151900 Sobic006G060200 Sobic006G060200 Sobic004G143400--Sobic006G060200 Sobic004G143400--Sobic008G008500 Sobic008G021700 Sobic008G021700 Sobic004G143400--Sobic008G021700 Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic004G143400--Sobic008G105300 Sobic007G210600--Sobic001G495300 Sobic007G210600--Sobic003G074700 Sobic007G210600--Sobic005G084000 Sobic007G210600--Sobic008G131700 Sobic007G210600--Sobic004G143400 Sobic007G210600--Sobic007G201400 Sobic009G136900 Sobic009G136900 Sobic007G210600--Sobic009G136900 Sobic007G210600--Sobic006G248200 Sobic007G210600--Sobic004G015700 Sobic001G118500--Sobic005G020700 Sobic004G246800 Sobic004G246800 Sobic001G118500--Sobic004G246800 Sobic001G076200 Sobic001G076200 Sobic001G118500--Sobic001G076200 Sobic001G118500--Sobic004G255500 Sobic001G118500--Sobic001G337600 Sobic009G212000 Sobic009G212000 Sobic001G118500--Sobic009G212000 Sobic002G305700 Sobic002G305700 Sobic001G118500--Sobic002G305700 Sobic002G190100 Sobic002G190100 Sobic001G118500--Sobic002G190100 Sobic009G004800 Sobic009G004800 Sobic001G118500--Sobic009G004800 Sobic002G114700 Sobic002G114700 Sobic003G114100--Sobic002G114700 Sobic003G114100--Sobic001G076200 Sobic008G078900 Sobic008G078900 Sobic003G114100--Sobic008G078900 Sobic010G052500 Sobic010G052500 Sobic003G114100--Sobic010G052500 Sobic003G014000 Sobic003G014000 Sobic003G114100--Sobic003G014000 Sobic003G114100--Sobic007G201400 Sobic003G114100--Sobic008G131700 Sobic006G273400 Sobic006G273400 Sobic003G114100--Sobic006G273400 Sobic001G514100 Sobic001G514100 Sobic003G114100--Sobic001G514100
Octagon: transcription factors


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