Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G242800.1
Synonym Sb02g027980
Functional annotation UBX domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QD87
Pfam PF00789
Panther DB PTHR23322 PTHR23322:SF32
NCBI CDD KOG2689; Predicted ubiquitin regulatory protein
KEGG Orthology K18726; FAF2, FAS-associated factor 2
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10790 : UBX domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g30411.1 : UBX domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047403
Brachypodium KQJ90707
Barley HORVU5Hr1G072140.4 , HORVU5Hr1G072140.3 , HORVU5Hr1G072140.2 , HORVU5Hr1G072140.1
Wheat TraesCS5A02G258700 , TraesCS5D02G266600 , TraesCS5B02G257600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G242800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G082550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G242800 Sobic002G242800 Sobic001G243800 Sobic001G243800 Sobic002G242800--Sobic001G243800 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic002G242800--Sobic002G315450 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic002G242800--Sobic007G044350 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic002G242800--Sobic001G104050 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic002G242800--Sobic004G070150 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic002G242800--Sobic002G107700 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic002G242800--Sobic004G357600 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic002G242800--Sobic001G296600 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G242800--Sobic006G119100 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic001G243800--Sobic008G082550 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G243800--Sobic001G378900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic001G243800--Sobic003G230800 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G243800--Sobic006G128150 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic001G243800--Sobic003G028700 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic001G243800--Sobic002G200400 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic001G243800--Sobic007G167600 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G243800--Sobic008G132550 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G243800--Sobic001G036400 Sobic002G315450--Sobic006G119100 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic002G315450--Sobic002G202350 Sobic002G315450--Sobic002G107700 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic002G315450--Sobic010G184201 Sobic001G065400 Sobic001G065400 Sobic002G315450--Sobic001G065400 Sobic002G315450--Sobic003G028700 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic002G315450--Sobic003G068200 Sobic008G165500 Sobic008G165500 Sobic002G315450--Sobic008G165500 Sobic002G315450--Sobic001G104050 Sobic007G044350--Sobic001G296600 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic007G044350--Sobic004G060000 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic007G044350--Sobic010G217466 Sobic007G044350--Sobic001G104050 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic006G108900 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic007G044350--Sobic002G262500 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic007G044350--Sobic003G276700 Sobic007G044350--Sobic006G119100 Sobic007G044350--Sobic004G357600 Sobic001G104050--Sobic001G296600 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G104050--Sobic010G265400 Sobic001G104050--Sobic004G357600 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic001G104050--Sobic002G411700 Sobic001G104050--Sobic007G044350 Sobic004G070400 Sobic004G070400 Sobic001G104050--Sobic004G070400 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic001G104050--Sobic004G249200 Sobic001G104050--Sobic001G036400 Sobic001G104050--Sobic004G070150 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic003G276700 Sobic004G070150--Sobic002G107700 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic004G070150--Sobic003G399800 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic004G070150--Sobic004G237900 Sobic007G137750 Sobic007G137750 Sobic004G070150--Sobic007G137750 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic010G084900 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic004G070150--Sobic007G052000 Sobic004G070150--Sobic001G296600 Sobic002G107700--Sobic010G184201 Sobic002G107700--Sobic004G237900 Sobic002G107700--Sobic004G070150 Sobic002G107700--Sobic003G399800 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic002G107700--Sobic001G385132 Sobic002G107700--Sobic002G315450 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic002G107700--Sobic002G208301 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G107700--Sobic007G038200 Sobic002G107700--Sobic003G276700 Sobic004G357600--Sobic004G249200 Sobic004G357600--Sobic001G296600 Sobic004G357600--Sobic001G104050 Sobic005G222000 Sobic005G222000 Sobic004G357600--Sobic005G222000 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic004G357600--Sobic007G174500 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic004G357600--Sobic007G174000 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic004G357600--Sobic004G138100 Sobic004G357600--Sobic010G265400 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic004G357600--Sobic009G011100 Sobic001G296600--Sobic001G104050 Sobic001G296600--Sobic007G044350 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic001G296600--Sobic004G223350 Sobic001G296600--Sobic004G357600 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic001G296600--Sobic003G267600 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic001G296600--Sobic007G173901 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic001G296600--Sobic004G205900 Sobic001G296600--Sobic003G276700 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic001G296600--Sobic002G008701 Sobic006G119100--Sobic007G038200 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic006G119100--Sobic002G380150 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic006G119100--Sobic007G174701 Sobic006G119100--Sobic002G315450 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic006G119100--Sobic007G206600 Sobic006G119100--Sobic007G044350 Sobic006G119100--Sobic001G296600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic006G119100--Sobic008G086100 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic006G119100--Sobic006G045301
Octagon: transcription factors


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