Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G399300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QFY9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g33670.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004016
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G120400 methyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.010G143600 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G534466 - -
4 Sobic.002G078100 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G051400 aminoacyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
6 Sobic.003G194800 EF hand family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G173400 expressed protein -
8 Sobic.008G087200 argonaute, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
9 Sobic.003G204100 expressed protein -
10 Sobic.007G140100 mitochondrial glycoprotein, putative, expressed K15414: complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial
11 Sobic.004G215600 - K15271: HFM1, ATP-dependent DNA helicase HFM1/MER3
12 Sobic.008G047500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.007G034200 expressed protein K10875: RAD54L, DNA repair and recombination protein RAD54 and RAD54-like protein
14 Sobic.003G028400 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G336400 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G117900 CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.18 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K07359: calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2
17 Sobic.009G054400 ECT protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G018900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G010200 - -
20 Sobic.006G220400 exonuclease, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G399300 Sobic002G399300 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic002G399300--Sobic009G120400 Sobic010G143600 Sobic010G143600 Sobic002G399300--Sobic010G143600 Sobic001G534466 Sobic001G534466 Sobic002G399300--Sobic001G534466 Sobic002G078100 Sobic002G078100 Sobic002G399300--Sobic002G078100 Sobic001G051400 Sobic001G051400 Sobic002G399300--Sobic001G051400 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic002G399300--Sobic003G194800 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic002G399300--Sobic002G173400 Sobic008G087200 Sobic008G087200 Sobic002G399300--Sobic008G087200 Sobic003G204100 Sobic003G204100 Sobic002G399300--Sobic003G204100 Sobic009G120400--Sobic002G173400 Sobic002G426100 Sobic002G426100 Sobic009G120400--Sobic002G426100 Sobic007G034200 Sobic007G034200 Sobic009G120400--Sobic007G034200 Sobic009G120400--Sobic003G194800 Sobic004G215600 Sobic004G215600 Sobic009G120400--Sobic004G215600 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic009G120400--Sobic007G105700 Sobic003G299500 Sobic003G299500 Sobic009G120400--Sobic003G299500 Sobic007G186400 Sobic007G186400 Sobic009G120400--Sobic007G186400 Sobic009G120400--Sobic001G051400 Sobic005G078700 Sobic005G078700 Sobic010G143600--Sobic005G078700 Sobic010G143600--Sobic002G173400 Sobic010G143600--Sobic003G194800 Sobic010G143600--Sobic009G120400 Sobic003G183466 Sobic003G183466 Sobic010G143600--Sobic003G183466 Sobic010G143600--Sobic003G204100 Sobic006G008300 Sobic006G008300 Sobic010G143600--Sobic006G008300 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic010G143600--Sobic003G397100 Sobic003G184666 Sobic003G184666 Sobic010G143600--Sobic003G184666 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic001G534466--Sobic004G298600 Sobic001G433600 Sobic001G433600 Sobic001G534466--Sobic001G433600 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic001G534466--Sobic006G189000 Sobic001G380700 Sobic001G380700 Sobic001G534466--Sobic001G380700 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic001G534466--Sobic001G117900 Sobic005G210500 Sobic005G210500 Sobic001G534466--Sobic005G210500 Sobic010G009700 Sobic010G009700 Sobic001G534466--Sobic010G009700 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic001G534466--Sobic002G286632 Sobic009G054400 Sobic009G054400 Sobic001G534466--Sobic009G054400 Sobic002G066800 Sobic002G066800 Sobic002G078100--Sobic002G066800 Sobic002G078100--Sobic002G426100 Sobic002G078100--Sobic009G120400 Sobic008G047500 Sobic008G047500 Sobic002G078100--Sobic008G047500 Sobic006G191200 Sobic006G191200 Sobic002G078100--Sobic006G191200 Sobic002G078100--Sobic001G051400 Sobic008G111600 Sobic008G111600 Sobic002G078100--Sobic008G111600 Sobic002G078100--Sobic003G194800 Sobic002G078100--Sobic007G034200 Sobic001G051400--Sobic002G066800 Sobic001G051400--Sobic007G034200 Sobic003G393200 Sobic003G393200 Sobic001G051400--Sobic003G393200 Sobic003G010900 Sobic003G010900 Sobic001G051400--Sobic003G010900 Sobic001G051400--Sobic009G120400 Sobic001G051400--Sobic006G191200 Sobic005G087300 Sobic005G087300 Sobic001G051400--Sobic005G087300 Sobic001G051400--Sobic002G078100 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic001G051400--Sobic005G123400 Sobic008G085950 Sobic008G085950 Sobic003G194800--Sobic008G085950 Sobic003G194800--Sobic008G047500 Sobic003G194800--Sobic009G120400 Sobic003G194800--Sobic003G204100 Sobic003G194800--Sobic002G173400 Sobic003G194800--Sobic003G299500 Sobic003G194800--Sobic007G105700 Sobic003G194800--Sobic004G215600 Sobic003G420400 Sobic003G420400 Sobic003G194800--Sobic003G420400 Sobic008G131900 Sobic008G131900 Sobic002G173400--Sobic008G131900 Sobic002G173400--Sobic009G120400 Sobic002G173400--Sobic003G194800 Sobic002G173400--Sobic008G047500 Sobic002G052800 Sobic002G052800 Sobic002G173400--Sobic002G052800 Sobic010G038200 Sobic010G038200 Sobic002G173400--Sobic010G038200 Sobic002G173400--Sobic010G143600 Sobic004G000400 Sobic004G000400 Sobic002G173400--Sobic004G000400 Sobic005G060100 Sobic005G060100 Sobic002G173400--Sobic005G060100 Sobic002G274700 Sobic002G274700 Sobic008G087200--Sobic002G274700 Sobic006G100266 Sobic006G100266 Sobic008G087200--Sobic006G100266 Sobic010G009600 Sobic010G009600 Sobic008G087200--Sobic010G009600 Sobic001G534400 Sobic001G534400 Sobic008G087200--Sobic001G534400 Sobic010G038900 Sobic010G038900 Sobic008G087200--Sobic010G038900 Sobic006G272300 Sobic006G272300 Sobic008G087200--Sobic006G272300 Sobic006G184200 Sobic006G184200 Sobic008G087200--Sobic006G184200 Sobic010G018900 Sobic010G018900 Sobic008G087200--Sobic010G018900 Sobic003G343200 Sobic003G343200 Sobic008G087200--Sobic003G343200 Sobic003G204100--Sobic008G047500 Sobic003G204100--Sobic003G194800 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic003G204100--Sobic003G045450 Sobic003G204100--Sobic004G298600 Sobic003G204100--Sobic008G085950 Sobic003G204100--Sobic002G173400 Sobic003G204100--Sobic010G143600 Sobic003G204100--Sobic001G117900 Sobic007G102000 Sobic007G102000 Sobic003G204100--Sobic007G102000
Octagon: transcription factors


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