Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G126500.1
Synonym Sb03g010700
Functional annotation hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q2V2
Pfam PF00682
Panther DB PTHR10277 PTHR10277:SF41
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01640; E4.1.3.4, HMGCL, hydroxymethylglutaryl-CoA lyase
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26800 : Aldolase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g16350.1 : hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035247
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3A02G185500 , TraesCS3A02G185500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G126500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic003G126500 Sobic003G126500 Sobic006G192400 Sobic006G192400 Sobic003G126500--Sobic006G192400 Sobic001G017900 Sobic001G017900 Sobic003G126500--Sobic001G017900 Sobic003G161200 Sobic003G161200 Sobic003G126500--Sobic003G161200 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic003G126500--Sobic002G360701 Sobic005G169800 Sobic005G169800 Sobic003G126500--Sobic005G169800 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic003G126500--Sobic005G155001 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic003G126500--Sobic001G204200 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic003G126500--Sobic001G483200 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic003G126500--Sobic008G185000 Sobic006G192400--Sobic001G017900 Sobic002G285300 Sobic002G285300 Sobic006G192400--Sobic002G285300 Sobic003G267900 Sobic003G267900 Sobic006G192400--Sobic003G267900 Sobic004G284400 Sobic004G284400 Sobic006G192400--Sobic004G284400 Sobic003G397000 Sobic003G397000 Sobic006G192400--Sobic003G397000 Sobic006G192400--Sobic003G126500 Sobic006G157300 Sobic006G157300 Sobic006G192400--Sobic006G157300 Sobic001G061500 Sobic001G061500 Sobic006G192400--Sobic001G061500 Sobic007G156101 Sobic007G156101 Sobic006G192400--Sobic007G156101 Sobic001G017900--Sobic006G192400 Sobic001G017900--Sobic002G285300 Sobic008G163700 Sobic008G163700 Sobic001G017900--Sobic008G163700 Sobic001G017900--Sobic007G156101 Sobic001G017900--Sobic003G267900 Sobic001G017900--Sobic006G157300 Sobic001G017900--Sobic004G284400 Sobic009G255300 Sobic009G255300 Sobic001G017900--Sobic009G255300 Sobic010G036000 Sobic010G036000 Sobic001G017900--Sobic010G036000 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic003G161200--Sobic004G223350 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic003G161200--Sobic002G142350 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic003G161200--Sobic008G112400 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic003G161200--Sobic008G086100 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic003G161200--Sobic002G346250 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic003G161200--Sobic001G311700 Sobic003G161200--Sobic005G169800 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic003G161200--Sobic005G083866 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic003G161200--Sobic008G175600 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic002G360701--Sobic009G184500 Sobic002G360701--Sobic001G483200 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic002G360701--Sobic007G017300 Sobic002G360701--Sobic005G155001 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic002G360701--Sobic004G190800 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic002G360701--Sobic007G213500 Sobic001G361750 Sobic001G361750 Sobic002G360701--Sobic001G361750 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic002G360701--Sobic001G468200 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic002G360701--Sobic001G368000 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic005G169800--Sobic006G280900 Sobic005G169800--Sobic001G204200 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic005G169800--Sobic006G146400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic005G169800--Sobic006G222650 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic005G169800--Sobic009G236000 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic005G169800--Sobic009G083100 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic005G169800--Sobic004G302400 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic005G169800--Sobic007G119300 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic005G169800--Sobic009G082500 Sobic005G155001--Sobic001G483200 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic005G155001--Sobic009G114900 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic005G155001--Sobic009G004500 Sobic005G155001--Sobic007G017300 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic005G155001--Sobic010G021401 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic005G155001--Sobic001G527900 Sobic005G155001--Sobic001G368000 Sobic005G155001--Sobic008G185000 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic005G155001--Sobic007G090406 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic001G204200--Sobic009G258150 Sobic009G250800 Sobic009G250800 Sobic001G204200--Sobic009G250800 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G204200--Sobic006G103601 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic001G204200--Sobic010G244701 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic001G204200--Sobic010G257300 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic001G204200--Sobic002G076932 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic001G204200--Sobic008G166250 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G204200--Sobic005G094500 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic001G204200--Sobic003G379500 Sobic001G483200--Sobic007G017300 Sobic001G483200--Sobic005G155001 Sobic001G483200--Sobic009G004500 Sobic001G483200--Sobic001G368000 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic001G483200--Sobic007G061500 Sobic001G483200--Sobic007G213500 Sobic001G483200--Sobic001G527900 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic001G483200--Sobic001G028500 Sobic001G483200--Sobic001G468200 Sobic008G185000--Sobic005G155001 Sobic008G185000--Sobic009G004500 Sobic008G185000--Sobic001G483200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic008G185000--Sobic001G490600 Sobic008G185000--Sobic010G021401 Sobic008G185000--Sobic001G368000 Sobic008G185000--Sobic007G017300 Sobic008G185000--Sobic009G114900 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic008G185000--Sobic002G252700
Octagon: transcription factors


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