Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G241100.3,Sobic.003G241100.1,Sobic.003G241100.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q549 , A0A1W0VYQ2 , A0A1W0VYP0
Pfam PF02163
Panther DB PTHR13325 PTHR13325:SF3
NCBI CDD KOG2921; Intramembrane metalloprotease (sterol-regulatory element-binding protein (SREBP) protease)
KEGG Orthology K07765; S2P endopeptidase
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004222metalloendopeptidase activity GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G20310 : Peptidase M50 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46590.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028207
Brachypodium PNT72520 , KQK08996 , KQK08995 , KQK08998 , PNT72515 , PNT72514 , PNT72517 , PNT72516 , PNT72511 , PNT72513 , PNT72512 , KQK08997 , PNT72519 , PNT72518
Barley -
Wheat TraesCS3B02G263000 , TraesCS3D02G237200 , TraesCS3D02G237200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G096900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G241100 Sobic003G241100 Sobic004G040350 Sobic004G040350 Sobic003G241100--Sobic004G040350 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic003G241100--Sobic008G087866 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic003G241100--Sobic009G165700 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic003G241100--Sobic002G211800 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic003G241100--Sobic003G166750 Sobic001G111850 Sobic001G111850 Sobic003G241100--Sobic001G111850 Sobic004G140600 Sobic004G140600 Sobic003G241100--Sobic004G140600 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic003G241100--Sobic003G170900 Sobic008G063300 Sobic008G063300 Sobic003G241100--Sobic008G063300 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G040350--Sobic001G456900 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic004G040350--Sobic007G161300 Sobic007G146100 Sobic007G146100 Sobic004G040350--Sobic007G146100 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic004G040350--Sobic010G139000 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic004G040350--Sobic002G180666 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic004G040350--Sobic008G028700 Sobic004G040350--Sobic003G241100 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic004G040350--Sobic002G145101 Sobic002G151300 Sobic002G151300 Sobic004G040350--Sobic002G151300 Sobic008G087866--Sobic009G165700 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic008G087866--Sobic003G422500 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic008G087866--Sobic008G001200 Sobic001G117200 Sobic001G117200 Sobic008G087866--Sobic001G117200 Sobic008G087866--Sobic003G166750 Sobic005G001000 Sobic005G001000 Sobic008G087866--Sobic005G001000 Sobic008G087866--Sobic003G170900 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic008G087866--Sobic001G194200 Sobic001G370900 Sobic001G370900 Sobic008G087866--Sobic001G370900 Sobic009G165700--Sobic003G422500 Sobic010G247800 Sobic010G247800 Sobic009G165700--Sobic010G247800 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic009G165700--Sobic010G206900 Sobic009G165700--Sobic003G166750 Sobic009G165700--Sobic008G087866 Sobic001G451400 Sobic001G451400 Sobic009G165700--Sobic001G451400 Sobic009G165700--Sobic003G170900 Sobic001G534700 Sobic001G534700 Sobic009G165700--Sobic001G534700 Sobic009G165700--Sobic008G001200 Sobic002G211800--Sobic009G165700 Sobic007G031900 Sobic007G031900 Sobic002G211800--Sobic007G031900 Sobic002G344000 Sobic002G344000 Sobic002G211800--Sobic002G344000 Sobic002G211800--Sobic003G166750 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic002G211800--Sobic004G023000 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic002G211800--Sobic009G132700 Sobic002G211800--Sobic003G170900 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic002G211800--Sobic002G294800 Sobic003G362600 Sobic003G362600 Sobic002G211800--Sobic003G362600 Sobic003G166750--Sobic009G165700 Sobic003G166750--Sobic008G001200 Sobic009G256400 Sobic009G256400 Sobic003G166750--Sobic009G256400 Sobic003G166750--Sobic001G370900 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic003G166750--Sobic001G289800 Sobic002G316600 Sobic002G316600 Sobic003G166750--Sobic002G316600 Sobic003G166750--Sobic001G194200 Sobic001G527800 Sobic001G527800 Sobic003G166750--Sobic001G527800 Sobic001G457800 Sobic001G457800 Sobic003G166750--Sobic001G457800 Sobic001G111850--Sobic003G166750 Sobic001G111850--Sobic009G165700 Sobic001G439300 Sobic001G439300 Sobic001G111850--Sobic001G439300 Sobic001G111850--Sobic008G001200 Sobic001G111850--Sobic009G256400 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic001G111850--Sobic001G433800 Sobic001G111850--Sobic001G370900 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic001G111850--Sobic010G123600 Sobic002G042600 Sobic002G042600 Sobic001G111850--Sobic002G042600 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic004G140600--Sobic001G227200 Sobic009G177500 Sobic009G177500 Sobic004G140600--Sobic009G177500 Sobic004G140600--Sobic008G063300 Sobic004G140600--Sobic009G132700 Sobic001G455600 Sobic001G455600 Sobic004G140600--Sobic001G455600 Sobic004G140600--Sobic010G139000 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic004G140600--Sobic002G343901 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic004G140600--Sobic001G219600 Sobic004G140600--Sobic001G433800 Sobic003G170900--Sobic009G165700 Sobic003G170900--Sobic010G123600 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G170900--Sobic005G112300 Sobic003G170900--Sobic010G206900 Sobic003G170900--Sobic010G139000 Sobic003G170900--Sobic003G422500 Sobic003G170900--Sobic003G166750 Sobic003G170900--Sobic010G247800 Sobic003G170900--Sobic001G194200 Sobic008G063300--Sobic004G140600 Sobic008G063300--Sobic001G433800 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic008G063300--Sobic006G096900 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic008G063300--Sobic003G360400 Sobic003G095900 Sobic003G095900 Sobic008G063300--Sobic003G095900 Sobic008G063300--Sobic010G123600 Sobic003G188400 Sobic003G188400 Sobic008G063300--Sobic003G188400 Sobic008G063300--Sobic009G177500 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic008G063300--Sobic010G059500
Octagon: transcription factors


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