Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G311150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZR6
Pfam -
Panther DB PTHR33018 PTHR33018:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g16210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G445900 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -
2 Sobic.003G415600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.003G045400 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7, putative, expressed K03015: RPB7, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
4 Sobic.009G013100 rp3 protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G010600 U2 small nuclear ribonucleoprotein A, putative, expressed K11092: U2 small nuclear ribonucleoprotein A'
6 Sobic.004G079200 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K09529: DnaJ homolog subfamily C member 9
7 Sobic.001G085000 expressed protein -
8 Sobic.009G030300 RNA polymerase II-associated protein 3, putative, expressed -
9 Sobic.003G380400 expressed protein -
10 Sobic.004G350100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed K05610: UCHL5, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5
11 Sobic.001G080000 expressed protein -
12 Sobic.006G253500 expressed protein -
13 Sobic.010G128500 - -
14 Sobic.002G357100 SUMO-activating enzyme subunit 2, putative, expressed K10685: UBLE1B, SAE2, ubiquitin-like 1-activating enzyme E1 B
15 Sobic.010G278100 expressed protein -
16 Sobic.001G429400 wibg, putative, expressed K14294: WIBG, partner of Y14 and mago
17 Sobic.006G267300 expressed protein -
18 Sobic.002G313500 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
19 Sobic.002G058300 ES43 protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G211300 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17499: PPM1G, protein phosphatase 1G


Gene co-expression network
sample Sobic003G311150 Sobic003G311150 Sobic003G445900 Sobic003G445900 Sobic003G311150--Sobic003G445900 Sobic003G415600 Sobic003G415600 Sobic003G311150--Sobic003G415600 Sobic003G045400 Sobic003G045400 Sobic003G311150--Sobic003G045400 Sobic009G013100 Sobic009G013100 Sobic003G311150--Sobic009G013100 Sobic001G010600 Sobic001G010600 Sobic003G311150--Sobic001G010600 Sobic004G079200 Sobic004G079200 Sobic003G311150--Sobic004G079200 Sobic001G085000 Sobic001G085000 Sobic003G311150--Sobic001G085000 Sobic009G030300 Sobic009G030300 Sobic003G311150--Sobic009G030300 Sobic003G380400 Sobic003G380400 Sobic003G311150--Sobic003G380400 Sobic008G000800 Sobic008G000800 Sobic003G445900--Sobic008G000800 Sobic004G053300 Sobic004G053300 Sobic003G445900--Sobic004G053300 Sobic002G313500 Sobic002G313500 Sobic003G445900--Sobic002G313500 Sobic010G017800 Sobic010G017800 Sobic003G445900--Sobic010G017800 Sobic007G191100 Sobic007G191100 Sobic003G445900--Sobic007G191100 Sobic003G432900 Sobic003G432900 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Octagon: transcription factors


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