Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G320500.1
Synonym Sb03g036730
Functional annotation early nodulin 20 precursor, putative, expressed
UniProt C5XMB2
Pfam PF02298
Panther DB PTHR33021 PTHR33021:SF29
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009055; electron transfer activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07475 : Cupredoxin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g57690.1 : early nodulin 20 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027250
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G320500 Sobic003G320500 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic003G320500--Sobic010G161900 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic003G320500--Sobic005G130700 SobicK009800 SobicK009800 Sobic003G320500--SobicK009800 Sobic006G062300 Sobic006G062300 Sobic003G320500--Sobic006G062300 Sobic001G258100 Sobic001G258100 Sobic003G320500--Sobic001G258100 Sobic007G103800 Sobic007G103800 Sobic003G320500--Sobic007G103800 Sobic001G451800 Sobic001G451800 Sobic003G320500--Sobic001G451800 Sobic010G116100 Sobic010G116100 Sobic003G320500--Sobic010G116100 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic003G320500--Sobic005G110600 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic010G161900--Sobic002G023400 Sobic005G123900 Sobic005G123900 Sobic010G161900--Sobic005G123900 Sobic004G325300 Sobic004G325300 Sobic010G161900--Sobic004G325300 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic010G161900--Sobic008G167100 Sobic005G054700 Sobic005G054700 Sobic010G161900--Sobic005G054700 Sobic004G247300 Sobic004G247300 Sobic010G161900--Sobic004G247300 Sobic003G103000 Sobic003G103000 Sobic010G161900--Sobic003G103000 Sobic010G161900--Sobic003G320500 Sobic007G187400 Sobic007G187400 Sobic010G161900--Sobic007G187400 Sobic005G130700--Sobic005G110600 Sobic005G130700--Sobic006G062300 Sobic005G130700--Sobic010G116100 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic005G130700--Sobic003G419600 Sobic001G140800 Sobic001G140800 Sobic005G130700--Sobic001G140800 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic005G130700--Sobic003G277200 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic005G130700--Sobic009G134000 Sobic006G245600 Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic006G245600 Sobic003G272900 Sobic003G272900 Sobic005G130700--Sobic003G272900 SobicK009800--Sobic001G140800 Sobic001G388000 Sobic001G388000 SobicK009800--Sobic001G388000 Sobic003G366300 Sobic003G366300 SobicK009800--Sobic003G366300 Sobic001G129600 Sobic001G129600 SobicK009800--Sobic001G129600 Sobic010G133932 Sobic010G133932 SobicK009800--Sobic010G133932 Sobic005G145100 Sobic005G145100 SobicK009800--Sobic005G145100 SobicK009800--Sobic003G320500 SobicK009800--Sobic005G110600 Sobic008G021900 Sobic008G021900 SobicK009800--Sobic008G021900 Sobic006G062300--Sobic005G130700 Sobic006G062300--Sobic005G110600 Sobic006G062300--Sobic010G116100 Sobic006G062300--Sobic003G419600 Sobic010G007000 Sobic010G007000 Sobic006G062300--Sobic010G007000 Sobic006G062300--Sobic001G140800 Sobic008G170400 Sobic008G170400 Sobic006G062300--Sobic008G170400 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic006G062300--Sobic004G297950 Sobic007G202100 Sobic007G202100 Sobic006G062300--Sobic007G202100 Sobic004G259101 Sobic004G259101 Sobic001G258100--Sobic004G259101 Sobic009G259500 Sobic009G259500 Sobic001G258100--Sobic009G259500 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic001G258100--Sobic003G174900 Sobic002G072700 Sobic002G072700 Sobic001G258100--Sobic002G072700 Sobic010G010900 Sobic010G010900 Sobic001G258100--Sobic010G010900 Sobic004G168600 Sobic004G168600 Sobic001G258100--Sobic004G168600 Sobic007G142900 Sobic007G142900 Sobic001G258100--Sobic007G142900 Sobic001G267800 Sobic001G267800 Sobic001G258100--Sobic001G267800 Sobic001G514400 Sobic001G514400 Sobic001G258100--Sobic001G514400 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic007G103800--Sobic007G012800 Sobic005G227050 Sobic005G227050 Sobic007G103800--Sobic005G227050 Sobic007G103800--Sobic009G134000 Sobic002G179700 Sobic002G179700 Sobic007G103800--Sobic002G179700 Sobic009G154100 Sobic009G154100 Sobic007G103800--Sobic009G154100 Sobic007G103800--Sobic005G130700 Sobic005G196500 Sobic005G196500 Sobic007G103800--Sobic005G196500 Sobic003G420800 Sobic003G420800 Sobic007G103800--Sobic003G420800 Sobic005G209900 Sobic005G209900 Sobic007G103800--Sobic005G209900 Sobic001G253900 Sobic001G253900 Sobic001G451800--Sobic001G253900 Sobic003G400600 Sobic003G400600 Sobic001G451800--Sobic003G400600 Sobic007G113900 Sobic007G113900 Sobic001G451800--Sobic007G113900 Sobic003G420100 Sobic003G420100 Sobic001G451800--Sobic003G420100 Sobic008G156900 Sobic008G156900 Sobic001G451800--Sobic008G156900 Sobic001G451800--Sobic003G277200 Sobic010G104400 Sobic010G104400 Sobic001G451800--Sobic010G104400 Sobic006G214000 Sobic006G214000 Sobic001G451800--Sobic006G214000 Sobic010G181500 Sobic010G181500 Sobic001G451800--Sobic010G181500 Sobic010G116100--Sobic005G130700 Sobic010G116100--Sobic006G062300 Sobic005G130550 Sobic005G130550 Sobic010G116100--Sobic005G130550 Sobic010G116100--Sobic007G012800 Sobic010G116100--Sobic005G110600 Sobic010G116100--Sobic003G419600 Sobic010G116100--Sobic004G297950 Sobic010G116100--Sobic003G277200 Sobic010G116100--Sobic009G134000 Sobic005G110600--Sobic005G130700 Sobic005G110600--Sobic006G062300 Sobic005G110600--Sobic004G297950 Sobic005G110600--Sobic001G140800 Sobic005G110600--Sobic003G419600 Sobic005G110600--Sobic010G133932 Sobic005G110600--Sobic010G007000 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic005G110600--Sobic003G269100 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic005G110600--Sobic001G484000
Octagon: transcription factors


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