Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G340000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q6T6
Pfam PF05097
Panther DB PTHR33257 PTHR33257:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G40475 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g60940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027035
Brachypodium PNT73124
Barley HORVU1Hr1G024540.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G094400 "cell wall modification, deposition of casparian strips, endodermis, transmembrane"(PubMedID : 24920445)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G247500 "HD-zip transcription factor, ortholog of sihdz02 of foxtail millet (Setaria italica L.)"(PubMedID : 29862293)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
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4 Sobic.009G176600 cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
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6 Sobic.001G342101 - -
7 Sobic.005G074300 - -
8 Sobic.008G050900 expressed protein -
9 Sobic.001G015000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@nuclear antigen, putative, expressed -
10 Sobic.001G103600 gp176, putative, expressed -
11 Sobic.008G030501 - -
12 Sobic.005G050400 syntaxin 6, putative, expressed -
13 Sobic.009G189700 - -
14 Sobic.009G107140 - -
15 Sobic.009G017600 cupin domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
17 Sobic.008G077400 - -
18 Sobic.005G144000 glycosyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.002G298600 LTPL63 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
20 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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