Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G247500.1
Synonym hdz, homeodomain leucine zipper (HD-Zip), Sb04g028740
Functional annotation "HD-zip transcription factor, ortholog of sihdz02 of foxtail millet (Setaria italica L.)" (PubMedID : 29862293)
caleosin related protein, putative, expressed
UniProt C5XZA4
Pfam PF05042
Panther DB PTHR31495 PTHR31495:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K17991; peroxygenase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G70670 : Caleosin-related family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g50140.1 : caleosin related protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021943
Brachypodium PNT69512
Barley -
Wheat TraesCS6A02G296300 , TraesCS6D02G276600 , TraesCS6B02G326100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G303900 CPuORF23 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
2 Sobic.009G157800 transporter family protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G189700 - -
4 Sobic.006G070564 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
5 Sobic.003G340000 expressed protein -
6 Sobic.008G050900 expressed protein -
7 Sobic.005G144000 glycosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.005G074300 - -
9 Sobic.009G176600 cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
10 Sobic.005G050400 syntaxin 6, putative, expressed -
11 Sobic.003G212000 OsCML12 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
12 Sobic.003G013700 vacuolar ATP synthase subunit E, putative, expressed K02150: ATPeV1E, V-type H+-transporting ATPase subunit E
13 Sobic.001G503600 expressed protein -
14 Sobic.001G039100 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G113200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
16 Sobic.004G279200 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
17 Sobic.003G284100 expressed protein -
18 Sobic.009G017600 cupin domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G176000 membrane protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G342101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G247500 Sobic004G247500 Sobic001G303900 Sobic001G303900 Sobic004G247500--Sobic001G303900 Sobic009G157800 Sobic009G157800 Sobic004G247500--Sobic009G157800 Sobic009G189700 Sobic009G189700 Sobic004G247500--Sobic009G189700 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic004G247500--Sobic006G070564 Sobic003G340000 Sobic003G340000 Sobic004G247500--Sobic003G340000 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic004G247500--Sobic008G050900 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic004G247500--Sobic005G144000 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic004G247500--Sobic005G074300 Sobic009G176600 Sobic009G176600 Sobic004G247500--Sobic009G176600 Sobic001G303900--Sobic004G247500 Sobic001G303900--Sobic009G189700 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic001G303900--Sobic005G050400 Sobic004G120500 Sobic004G120500 Sobic001G303900--Sobic004G120500 Sobic003G013700 Sobic003G013700 Sobic001G303900--Sobic003G013700 Sobic001G303900--Sobic005G144000 Sobic003G089100 Sobic003G089100 Sobic001G303900--Sobic003G089100 Sobic001G342101 Sobic001G342101 Sobic001G303900--Sobic001G342101 Sobic002G420600 Sobic002G420600 Sobic001G303900--Sobic002G420600 Sobic009G157800--Sobic005G144000 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic009G157800--Sobic008G071300 Sobic004G154100 Sobic004G154100 Sobic009G157800--Sobic004G154100 Sobic008G122800 Sobic008G122800 Sobic009G157800--Sobic008G122800 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic009G157800--Sobic001G039100 Sobic004G180100 Sobic004G180100 Sobic009G157800--Sobic004G180100 Sobic001G503600 Sobic001G503600 Sobic009G157800--Sobic001G503600 Sobic003G212000 Sobic003G212000 Sobic009G157800--Sobic003G212000 Sobic002G170100 Sobic002G170100 Sobic009G157800--Sobic002G170100 Sobic009G189700--Sobic005G144000 Sobic009G189700--Sobic002G170100 Sobic009G189700--Sobic001G503600 Sobic009G189700--Sobic008G071300 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic009G189700--Sobic006G272400 Sobic009G189700--Sobic001G039100 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic009G189700--Sobic009G242200 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic009G189700--Sobic003G441000 Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic009G189700--Sobic005G042900 Sobic006G070564--Sobic001G039100 Sobic004G279200 Sobic004G279200 Sobic006G070564--Sobic004G279200 Sobic006G189300 Sobic006G189300 Sobic006G070564--Sobic006G189300 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic006G070564--Sobic002G404600 Sobic006G070564--Sobic001G503600 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic006G070564--Sobic001G414650 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic006G070564--Sobic010G038300 Sobic001G357400 Sobic001G357400 Sobic006G070564--Sobic001G357400 Sobic007G196700 Sobic007G196700 Sobic006G070564--Sobic007G196700 Sobic010G094400 Sobic010G094400 Sobic003G340000--Sobic010G094400 Sobic003G340000--Sobic004G247500 Sobic001G502100 Sobic001G502100 Sobic003G340000--Sobic001G502100 Sobic003G340000--Sobic009G176600 Sobic003G340000--Sobic001G303900 Sobic003G340000--Sobic001G342101 Sobic003G340000--Sobic005G074300 Sobic003G340000--Sobic008G050900 Sobic001G015000 Sobic001G015000 Sobic003G340000--Sobic001G015000 Sobic008G050900--Sobic001G039100 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic005G074300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic008G050900--Sobic003G133201 Sobic008G050900--Sobic005G144000 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic008G050900--Sobic005G201501 Sobic008G050900--Sobic006G070564 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic008G050900--Sobic005G077001 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic008G050900--Sobic002G381500 Sobic005G144000--Sobic003G441000 Sobic005G144000--Sobic002G170100 Sobic005G144000--Sobic008G122800 Sobic001G279000 Sobic001G279000 Sobic005G144000--Sobic001G279000 Sobic005G144000--Sobic009G242200 Sobic005G144000--Sobic001G503600 Sobic005G144000--Sobic004G180100 Sobic005G144000--Sobic008G071300 Sobic005G144000--Sobic002G404600 Sobic005G074300--Sobic008G050900 Sobic005G074300--Sobic001G039100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic005G074300--Sobic010G129450 Sobic005G074300--Sobic002G381500 Sobic005G074300--Sobic003G133201 Sobic004G217100 Sobic004G217100 Sobic005G074300--Sobic004G217100 Sobic005G074300--Sobic001G414650 Sobic002G382300 Sobic002G382300 Sobic005G074300--Sobic002G382300 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic005G074300--Sobic006G224400 Sobic009G176600--Sobic010G094400 Sobic009G176600--Sobic001G502100 Sobic009G176600--Sobic003G340000 Sobic009G176600--Sobic004G247500 Sobic009G176600--Sobic001G015000 Sobic003G090200 Sobic003G090200 Sobic009G176600--Sobic003G090200 Sobic002G100300 Sobic002G100300 Sobic009G176600--Sobic002G100300 Sobic005G212300 Sobic005G212300 Sobic009G176600--Sobic005G212300 Sobic003G354850 Sobic003G354850 Sobic009G176600--Sobic003G354850
Octagon: transcription factors


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