Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G354300.1
Synonym Sb03g039660
Functional annotation csAtPR5, putative, expressed
UniProt C5XPR3
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g04590.1 : csAtPR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G354300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G034800 OsFBX440 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G020500 expressed protein K15198: BDP1, transcription factor TFIIIB component B''
3 Sobic.004G354200 expressed protein -
4 Sobic.007G193700 Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G168300 RGH2B, putative, expressed -
6 Sobic.003G138500 aspartic proteinase oryzasin-1 precursor, putative, expressed K08245: phytepsin
7 Sobic.003G161100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
8 Sobic.010G176550 - -
9 Sobic.006G216100 expressed protein -
10 Sobic.001G327800 uncharacterized mscS family protein, putative, expressed K16052: ynaI, MscS family membrane protein
11 Sobic.003G379400 PHD-finger domain containing protein, putative -
12 Sobic.003G381200 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
13 Sobic.003G369400 expressed protein -
14 Sobic.003G067100 aspartyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01876: aspartyl-tRNA synthetase
15 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
16 Sobic.001G534066 - -
17 Sobic.001G159400 protein kinase domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G434700 tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme gidA, putative, expressed K03495: gidA, mnmG, tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme
19 Sobic.002G127550 - -
20 Sobic.005G072100 preprotein translocase secA family protein, putative, expressed K03070: preprotein translocase subunit SecA


Gene co-expression network
sample Sobic003G354300 Sobic003G354300 Sobic004G034800 Sobic004G034800 Sobic003G354300--Sobic004G034800 Sobic007G020500 Sobic007G020500 Sobic003G354300--Sobic007G020500 Sobic004G354200 Sobic004G354200 Sobic003G354300--Sobic004G354200 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic003G354300--Sobic007G193700 Sobic002G168300 Sobic002G168300 Sobic003G354300--Sobic002G168300 Sobic003G138500 Sobic003G138500 Sobic003G354300--Sobic003G138500 Sobic003G161100 Sobic003G161100 Sobic003G354300--Sobic003G161100 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic003G354300--Sobic010G176550 Sobic006G216100 Sobic006G216100 Sobic003G354300--Sobic006G216100 Sobic004G034800--Sobic006G216100 Sobic004G034800--Sobic010G176550 Sobic004G034800--Sobic003G138500 Sobic002G127550 Sobic002G127550 Sobic004G034800--Sobic002G127550 Sobic003G052200 Sobic003G052200 Sobic004G034800--Sobic003G052200 Sobic001G035900 Sobic001G035900 Sobic004G034800--Sobic001G035900 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic004G034800--Sobic007G116200 Sobic008G162900 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Octagon: transcription factors


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