Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G018500.1,Sobic.004G018500.2
Synonym Sb04g001750
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKG5 , C6JSE2 , C5XT07
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02900.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034916
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G060000 - -
2 Sobic.010G153532 - -
3 Sobic.009G206400 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.007G209500 DNA-binding bromodomain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G165650 - -
6 Sobic.003G382300 no apical meristem protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G194200 EARLY flowering protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G063900 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
9 Sobic.008G086401 - -
10 Sobic.003G002600 -(PubMedID : 23001790)@GLK2(PubMedID : 24676859)@GLK genes are members of the GARP superfamily and functions in a BS or M cell-type specific manner to regulate the proplastid to chloroplast transition(PubMedID : 22968911)@myb-like DNA-binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G186200 thioredoxin, putative, expressed -
12 Sobic.002G175550 - -
13 Sobic.004G074200 abhydrolase domain-containing protein FAM108C1, putative, expressed -
14 Sobic.001G134600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@RNA methyltransferase, TrmH family protein, putative, expressed K03437: RNA methyltransferase, TrmH family
15 Sobic.005G097700 - -
16 Sobic.002G040500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.004G186600 cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
18 Sobic.001G419900 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@DnaK family protein, putative, expressed K03283: heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
19 Sobic.006G065900 expressed protein -
20 Sobic.001G077100 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G018500 Sobic004G018500 Sobic010G060000 Sobic010G060000 Sobic004G018500--Sobic010G060000 Sobic010G153532 Sobic010G153532 Sobic004G018500--Sobic010G153532 Sobic009G206400 Sobic009G206400 Sobic004G018500--Sobic009G206400 Sobic007G209500 Sobic007G209500 Sobic004G018500--Sobic007G209500 Sobic006G165650 Sobic006G165650 Sobic004G018500--Sobic006G165650 Sobic003G382300 Sobic003G382300 Sobic004G018500--Sobic003G382300 Sobic005G194200 Sobic005G194200 Sobic004G018500--Sobic005G194200 Sobic001G063900 Sobic001G063900 Sobic004G018500--Sobic001G063900 Sobic008G086401 Sobic008G086401 Sobic004G018500--Sobic008G086401 Sobic007G136600 Sobic007G136600 Sobic010G060000--Sobic007G136600 Sobic001G077100 Sobic001G077100 Sobic010G060000--Sobic001G077100 Sobic002G104000 Sobic002G104000 Sobic010G060000--Sobic002G104000 Sobic010G060000--Sobic004G018500 Sobic002G226100 Sobic002G226100 Sobic010G060000--Sobic002G226100 Sobic010G060000--Sobic009G206400 Sobic006G269400 Sobic006G269400 Sobic010G060000--Sobic006G269400 Sobic003G421400 Sobic003G421400 Sobic010G060000--Sobic003G421400 Sobic009G138900 Sobic009G138900 Sobic010G060000--Sobic009G138900 Sobic004G074200 Sobic004G074200 Sobic010G153532--Sobic004G074200 Sobic009G114600 Sobic009G114600 Sobic010G153532--Sobic009G114600 Sobic002G175550 Sobic002G175550 Sobic010G153532--Sobic002G175550 Sobic006G004000 Sobic006G004000 Sobic010G153532--Sobic006G004000 Sobic005G097700 Sobic005G097700 Sobic010G153532--Sobic005G097700 Sobic003G219400 Sobic003G219400 Sobic010G153532--Sobic003G219400 Sobic006G073150 Sobic006G073150 Sobic010G153532--Sobic006G073150 Sobic001G451200 Sobic001G451200 Sobic010G153532--Sobic001G451200 Sobic003G221300 Sobic003G221300 Sobic010G153532--Sobic003G221300 Sobic002G040500 Sobic002G040500 Sobic009G206400--Sobic002G040500 Sobic009G206400--Sobic006G165650 Sobic009G206400--Sobic010G060000 Sobic006G074100 Sobic006G074100 Sobic009G206400--Sobic006G074100 Sobic003G437600 Sobic003G437600 Sobic009G206400--Sobic003G437600 Sobic003G325300 Sobic003G325300 Sobic009G206400--Sobic003G325300 Sobic004G187100 Sobic004G187100 Sobic009G206400--Sobic004G187100 Sobic009G206400--Sobic003G382300 Sobic009G206400--Sobic001G077100 Sobic007G209500--Sobic004G018500 Sobic007G209500--Sobic006G165650 Sobic001G134600 Sobic001G134600 Sobic007G209500--Sobic001G134600 Sobic001G184900 Sobic001G184900 Sobic007G209500--Sobic001G184900 Sobic001G419900 Sobic001G419900 Sobic007G209500--Sobic001G419900 Sobic007G209500--Sobic003G382300 Sobic007G209500--Sobic009G206400 Sobic007G157800 Sobic007G157800 Sobic007G209500--Sobic007G157800 Sobic001G256900 Sobic001G256900 Sobic007G209500--Sobic001G256900 Sobic006G165650--Sobic007G157800 Sobic006G165650--Sobic002G040500 Sobic006G165650--Sobic009G206400 Sobic007G207300 Sobic007G207300 Sobic006G165650--Sobic007G207300 Sobic008G175700 Sobic008G175700 Sobic006G165650--Sobic008G175700 Sobic006G165650--Sobic002G175550 Sobic001G177200 Sobic001G177200 Sobic006G165650--Sobic001G177200 Sobic006G165650--Sobic005G097700 Sobic006G165650--Sobic001G256900 Sobic003G382300--Sobic009G206400 Sobic002G314200 Sobic002G314200 Sobic003G382300--Sobic002G314200 Sobic003G382300--Sobic004G018500 Sobic003G382300--Sobic006G074100 Sobic002G256000 Sobic002G256000 Sobic003G382300--Sobic002G256000 Sobic003G382300--Sobic001G077100 Sobic009G034600 Sobic009G034600 Sobic003G382300--Sobic009G034600 Sobic003G382300--Sobic003G421400 Sobic004G186200 Sobic004G186200 Sobic003G382300--Sobic004G186200 Sobic006G060800 Sobic006G060800 Sobic005G194200--Sobic006G060800 Sobic009G255100 Sobic009G255100 Sobic005G194200--Sobic009G255100 Sobic009G205600 Sobic009G205600 Sobic005G194200--Sobic009G205600 Sobic002G362100 Sobic002G362100 Sobic005G194200--Sobic002G362100 Sobic001G145050 Sobic001G145050 Sobic005G194200--Sobic001G145050 Sobic005G045200 Sobic005G045200 Sobic005G194200--Sobic005G045200 Sobic004G217700 Sobic004G217700 Sobic005G194200--Sobic004G217700 Sobic001G340700 Sobic001G340700 Sobic005G194200--Sobic001G340700 Sobic010G120800 Sobic010G120800 Sobic005G194200--Sobic010G120800 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic001G063900--Sobic009G010800 Sobic007G210400 Sobic007G210400 Sobic001G063900--Sobic007G210400 Sobic002G052500 Sobic002G052500 Sobic001G063900--Sobic002G052500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic001G063900--Sobic007G072901 Sobic004G356600 Sobic004G356600 Sobic001G063900--Sobic004G356600 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic001G063900--Sobic001G361500 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic001G063900--Sobic003G245700 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic001G063900--Sobic003G178200 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic001G063900--Sobic003G343100 Sobic003G022800 Sobic003G022800 Sobic008G086401--Sobic003G022800 Sobic006G212000 Sobic006G212000 Sobic008G086401--Sobic006G212000 Sobic004G357900 Sobic004G357900 Sobic008G086401--Sobic004G357900 Sobic008G086401--Sobic004G356600 Sobic008G086401--Sobic005G097700 Sobic008G086401--Sobic001G256900 Sobic003G222400 Sobic003G222400 Sobic008G086401--Sobic003G222400 Sobic009G070900 Sobic009G070900 Sobic008G086401--Sobic009G070900 Sobic007G169000 Sobic007G169000 Sobic008G086401--Sobic007G169000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.