Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G022900.1
Synonym Sb04g002055
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YM90
Pfam -
Panther DB PTHR19328 PTHR19328:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G74790 : catalytics
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g48540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G069800 OsWAK124 - OsWAK receptor-like protein OsWAK-RLP, expressed -
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11 Sobic.003G043500 - -
12 Sobic.003G345600 expressed protein -
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15 Sobic.004G245700 expressed protein -
16 Sobic.007G002700 OsWAK14 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
17 Sobic.001G280800 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.008G139600 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
19 Sobic.003G376100 4,5-DOPA dioxygenase extradiol, putative, expressed K15777: 4,5-DOPA dioxygenase extradiol
20 Sobic.002G176100 membrane protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G022900 Sobic004G022900 Sobic005G069800 Sobic005G069800 Sobic004G022900--Sobic005G069800 Sobic001G487600 Sobic001G487600 Sobic004G022900--Sobic001G487600 Sobic005G070200 Sobic005G070200 Sobic004G022900--Sobic005G070200 Sobic006G162100 Sobic006G162100 Sobic004G022900--Sobic006G162100 Sobic005G069700 Sobic005G069700 Sobic004G022900--Sobic005G069700 Sobic004G316350 Sobic004G316350 Sobic004G022900--Sobic004G316350 Sobic001G242000 Sobic001G242000 Sobic004G022900--Sobic001G242000 Sobic007G215600 Sobic007G215600 Sobic004G022900--Sobic007G215600 Sobic001G462700 Sobic001G462700 Sobic004G022900--Sobic001G462700 Sobic005G069800--Sobic005G070200 Sobic005G069800--Sobic005G069700 Sobic005G069800--Sobic004G022900 Sobic008G128200 Sobic008G128200 Sobic005G069800--Sobic008G128200 Sobic009G144800 Sobic009G144800 Sobic005G069800--Sobic009G144800 Sobic007G002700 Sobic007G002700 Sobic005G069800--Sobic007G002700 Sobic005G069800--Sobic001G487600 Sobic003G441500 Sobic003G441500 Sobic005G069800--Sobic003G441500 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic005G069800--Sobic005G177600 Sobic003G426600 Sobic003G426600 Sobic001G487600--Sobic003G426600 Sobic001G280800 Sobic001G280800 Sobic001G487600--Sobic001G280800 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic001G487600--Sobic002G012500 Sobic008G036800 Sobic008G036800 Sobic001G487600--Sobic008G036800 Sobic003G376100 Sobic003G376100 Sobic001G487600--Sobic003G376100 Sobic001G487600--Sobic004G022900 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic001G487600--Sobic008G022000 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic001G487600--Sobic008G158600 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic001G487600--Sobic009G145600 Sobic005G070200--Sobic005G069800 Sobic005G070200--Sobic005G069700 Sobic005G070200--Sobic009G144800 Sobic005G070200--Sobic004G022900 Sobic003G345600 Sobic003G345600 Sobic005G070200--Sobic003G345600 Sobic005G070200--Sobic001G487600 Sobic009G144900 Sobic009G144900 Sobic005G070200--Sobic009G144900 Sobic005G070200--Sobic005G177600 Sobic004G169300 Sobic004G169300 Sobic005G070200--Sobic004G169300 Sobic004G148100 Sobic004G148100 Sobic006G162100--Sobic004G148100 Sobic006G162100--Sobic007G215600 Sobic002G040900 Sobic002G040900 Sobic006G162100--Sobic002G040900 Sobic004G189500 Sobic004G189500 Sobic006G162100--Sobic004G189500 Sobic006G039100 Sobic006G039100 Sobic006G162100--Sobic006G039100 Sobic002G055700 Sobic002G055700 Sobic006G162100--Sobic002G055700 Sobic006G162100--Sobic005G177600 Sobic006G113500 Sobic006G113500 Sobic006G162100--Sobic006G113500 Sobic001G325400 Sobic001G325400 Sobic006G162100--Sobic001G325400 Sobic005G069700--Sobic005G069800 Sobic005G069700--Sobic005G070200 Sobic005G069700--Sobic007G002700 Sobic005G069700--Sobic004G022900 Sobic010G072100 Sobic010G072100 Sobic005G069700--Sobic010G072100 Sobic004G052300 Sobic004G052300 Sobic005G069700--Sobic004G052300 Sobic003G280100 Sobic003G280100 Sobic005G069700--Sobic003G280100 Sobic003G437100 Sobic003G437100 Sobic005G069700--Sobic003G437100 Sobic005G069700--Sobic009G144800 Sobic004G141100 Sobic004G141100 Sobic004G316350--Sobic004G141100 Sobic002G176100 Sobic002G176100 Sobic004G316350--Sobic002G176100 Sobic002G351300 Sobic002G351300 Sobic004G316350--Sobic002G351300 Sobic006G054800 Sobic006G054800 Sobic004G316350--Sobic006G054800 Sobic004G316350--Sobic001G242000 Sobic003G043500 Sobic003G043500 Sobic004G316350--Sobic003G043500 Sobic008G009400 Sobic008G009400 Sobic004G316350--Sobic008G009400 Sobic010G270700 Sobic010G270700 Sobic004G316350--Sobic010G270700 Sobic004G316350--Sobic009G145600 Sobic007G054900 Sobic007G054900 Sobic001G242000--Sobic007G054900 Sobic002G369400 Sobic002G369400 Sobic001G242000--Sobic002G369400 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic001G242000--Sobic002G063800 Sobic001G330300 Sobic001G330300 Sobic001G242000--Sobic001G330300 Sobic001G242000--Sobic010G270700 Sobic010G062300 Sobic010G062300 Sobic001G242000--Sobic010G062300 Sobic006G050800 Sobic006G050800 Sobic001G242000--Sobic006G050800 Sobic010G009900 Sobic010G009900 Sobic001G242000--Sobic010G009900 Sobic001G449100 Sobic001G449100 Sobic001G242000--Sobic001G449100 Sobic007G215600--Sobic004G148100 Sobic007G215600--Sobic006G162100 Sobic007G215600--Sobic005G177600 Sobic007G215600--Sobic001G449100 Sobic007G215600--Sobic004G189500 Sobic007G215600--Sobic009G145600 Sobic004G148200 Sobic004G148200 Sobic007G215600--Sobic004G148200 Sobic007G215600--Sobic002G369400 Sobic006G154500 Sobic006G154500 Sobic007G215600--Sobic006G154500 Sobic002G247600 Sobic002G247600 Sobic001G462700--Sobic002G247600 Sobic001G462700--Sobic001G325400 Sobic001G462700--Sobic006G039100 Sobic009G111000 Sobic009G111000 Sobic001G462700--Sobic009G111000 Sobic007G204700 Sobic007G204700 Sobic001G462700--Sobic007G204700 Sobic003G117600 Sobic003G117600 Sobic001G462700--Sobic003G117600 Sobic010G008400 Sobic010G008400 Sobic001G462700--Sobic010G008400 Sobic001G331200 Sobic001G331200 Sobic001G462700--Sobic001G331200 Sobic004G046200 Sobic004G046200 Sobic001G462700--Sobic004G046200
Octagon: transcription factors


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