Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G025900.1
Synonym XTR4, Sb04g002290, XTH30
Functional annotation glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed
UniProt C5XTQ9
Pfam PF06955 PF00722
Panther DB PTHR31062 PTHR31062:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology K08235; xyloglucan:xyloglucosyl transferase
Gene Ontology GO:0016762; xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity GO:0006073cellular glucan metabolic process GO:0005618cell wall GO:0005975carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G32170 : xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 30
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g03550.1 : glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034970 , Zm00025a052940
Brachypodium KQJ97938 , KQJ93088
Barley HORVU5Hr1G123920.1 , HORVU5Hr1G123920.2 , HORVU5Hr1G123920.3
Wheat TraesCSU02G018400 , TraesCS1D02G199300 , TraesCS6A02G088000 , TraesCS1A02G195900 , TraesCS1B02G210500 , TraesCS6B02G110400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G315000 fringe-related protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G028600 OsSub40 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
3 Sobic.006G264700 - -
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8 Sobic.001G539820 - -
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15 Sobic.007G222200 - -
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20 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase


Gene co-expression network
sample Sobic004G025900 Sobic004G025900 Sobic001G315000 Sobic001G315000 Sobic004G025900--Sobic001G315000 Sobic006G028600 Sobic006G028600 Sobic004G025900--Sobic006G028600 Sobic006G264700 Sobic006G264700 Sobic004G025900--Sobic006G264700 Sobic005G217101 Sobic005G217101 Sobic004G025900--Sobic005G217101 Sobic004G002300 Sobic004G002300 Sobic004G025900--Sobic004G002300 Sobic001G500900 Sobic001G500900 Sobic004G025900--Sobic001G500900 Sobic006G115800 Sobic006G115800 Sobic004G025900--Sobic006G115800 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic004G025900--Sobic001G539820 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic004G025900--Sobic010G190500 Sobic001G315000--Sobic006G028600 Sobic001G315000--Sobic004G002300 Sobic006G059100 Sobic006G059100 Sobic001G315000--Sobic006G059100 Sobic001G315000--Sobic001G500900 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic001G315000--Sobic001G135950 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic001G315000--Sobic006G215500 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic001G315000--Sobic004G071900 Sobic002G125100 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Octagon: transcription factors


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