Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110160.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJ10
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G091200 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G106800 expressed protein -
3 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
4 Sobic.004G350400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
5 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
6 Sobic.001G540000 expansin precursor, putative, expressed -
7 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
8 Sobic.010G056500 - -
9 Sobic.004G025500 - -
10 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
11 Sobic.005G010000 expressed protein -
12 Sobic.002G091300 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G025600 - -
14 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
15 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
17 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
18 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G220800 AGC_AGC_other_NDRh_TRCd.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K08790: STK38, serine/threonine kinase 38


Gene co-expression network
sample Sobic005G110160 Sobic005G110160 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic005G110160--Sobic002G091200 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic005G110160--Sobic002G106800 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic005G110160--Sobic010G161400 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic005G110160--Sobic004G350400 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic005G110160--Sobic009G098900 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic005G110160--Sobic001G540000 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic005G110160--Sobic003G173800 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic005G110160--Sobic010G056500 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic005G110160--Sobic004G025500 Sobic002G091200--Sobic001G540000 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic003G173800 Sobic002G091200--Sobic004G350400 Sobic002G091200--Sobic010G056500 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic002G091200--Sobic004G137200 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic004G131400 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G091200--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic004G350400--Sobic001G540000 Sobic004G350400--Sobic010G056500 Sobic004G350400--Sobic004G131400 Sobic004G350400--Sobic002G091200 Sobic004G350400--Sobic004G025600 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic004G350400--Sobic001G220800 Sobic002G282600 Sobic002G282600 Sobic004G350400--Sobic002G282600 Sobic004G350400--Sobic002G106800 Sobic004G350400--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic001G540000--Sobic004G025600 Sobic001G540000--Sobic002G091200 Sobic001G540000--Sobic010G056500 Sobic001G540000--Sobic004G131400 Sobic001G540000--Sobic004G350400 Sobic001G540000--Sobic002G106800 Sobic001G540000--Sobic004G137200 Sobic001G540000--Sobic003G173800 Sobic001G540000--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic010G056500--Sobic004G131400 Sobic010G056500--Sobic004G025600 Sobic010G056500--Sobic001G540000 Sobic010G056500--Sobic004G350400 Sobic010G056500--Sobic002G091200 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic010G056500--Sobic001G332200 Sobic010G056500--Sobic002G282600 Sobic010G056500--Sobic002G106800 Sobic010G056500--Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic010G161400
Octagon: transcription factors


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