Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G142501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S5M0
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF126
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g46510.1 : OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G105100 expressed protein -
2 Sobic.006G022700 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G125100 - -
4 Sobic.002G104801 - -
5 Sobic.004G350400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
6 Sobic.006G215500 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G110160 - -
8 Sobic.004G071900 expressed protein -
9 Sobic.001G220800 AGC_AGC_other_NDRh_TRCd.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K08790: STK38, serine/threonine kinase 38
10 Sobic.001G540000 expansin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.010G056500 - -
12 Sobic.004G025500 - -
13 Sobic.002G106800 expressed protein -
14 Sobic.002G091200 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G025600 - -
17 Sobic.002G091300 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G131400 DEF7 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
19 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
20 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G142501 Sobic001G142501 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic001G142501--Sobic009G105100 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic001G142501--Sobic006G022700 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic001G142501--Sobic002G125100 Sobic002G104801 Sobic002G104801 Sobic001G142501--Sobic002G104801 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic001G142501--Sobic004G350400 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic001G142501--Sobic006G215500 Sobic005G110160 Sobic005G110160 Sobic001G142501--Sobic005G110160 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic001G142501--Sobic004G071900 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic001G142501--Sobic001G220800 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic009G105100--Sobic010G252600 Sobic009G105100--Sobic004G071900 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic009G105100--Sobic009G102700 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic009G105100--Sobic004G166100 Sobic009G105100--Sobic006G215500 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G105100--Sobic004G025500 Sobic009G105100--Sobic002G125100 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic009G105100--Sobic001G135950 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic009G105100--Sobic007G057600 Sobic006G022700--Sobic006G215500 Sobic006G022700--Sobic001G220800 Sobic006G022700--Sobic004G071900 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic006G022700--Sobic009G098400 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic006G022700--Sobic003G313200 Sobic006G022700--Sobic004G350400 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic006G022700--Sobic002G279900 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic006G022700--Sobic004G187400 Sobic006G022700--Sobic001G135950 Sobic002G125100--Sobic001G135950 Sobic002G125100--Sobic004G071900 Sobic002G125100--Sobic006G215500 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic002G125100--Sobic004G099200 Sobic002G125100--Sobic002G279900 Sobic002G125100--Sobic009G105100 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic002G125100--Sobic010G001200 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic002G125100--Sobic001G525600 Sobic002G125100--Sobic003G313200 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic002G104801--Sobic004G251900 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic002G104801--Sobic009G098900 Sobic004G070600 Sobic004G070600 Sobic002G104801--Sobic004G070600 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G104801--Sobic010G161400 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic002G104801--Sobic002G002600 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G104801--Sobic003G173800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic002G104801--Sobic009G089532 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G104801--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic002G104801--Sobic001G539700 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic004G350400--Sobic001G540000 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic004G350400--Sobic010G056500 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic004G350400--Sobic004G131400 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic004G350400--Sobic002G091200 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic004G350400--Sobic004G025600 Sobic004G350400--Sobic001G220800 Sobic002G282600 Sobic002G282600 Sobic004G350400--Sobic002G282600 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic004G350400--Sobic002G106800 Sobic004G350400--Sobic003G173800 Sobic006G215500--Sobic004G071900 Sobic006G215500--Sobic001G135950 Sobic006G215500--Sobic006G022700 Sobic006G215500--Sobic002G125100 Sobic006G215500--Sobic003G313200 Sobic006G215500--Sobic001G220800 Sobic006G215500--Sobic004G025500 Sobic006G215500--Sobic009G102700 Sobic006G215500--Sobic004G099200 Sobic005G110160--Sobic002G091200 Sobic005G110160--Sobic002G106800 Sobic005G110160--Sobic010G161400 Sobic005G110160--Sobic004G350400 Sobic005G110160--Sobic009G098900 Sobic005G110160--Sobic001G540000 Sobic005G110160--Sobic003G173800 Sobic005G110160--Sobic010G056500 Sobic005G110160--Sobic004G025500 Sobic004G071900--Sobic006G215500 Sobic004G071900--Sobic001G135950 Sobic004G071900--Sobic002G125100 Sobic004G071900--Sobic004G099200 Sobic004G071900--Sobic009G105100 Sobic004G071900--Sobic009G102700 Sobic004G071900--Sobic003G313200 Sobic004G071900--Sobic006G022700 Sobic004G071900--Sobic002G279900 Sobic001G220800--Sobic004G350400 Sobic001G220800--Sobic001G540000 Sobic001G220800--Sobic002G282600 Sobic001G220800--Sobic002G091200 Sobic001G220800--Sobic004G131400 Sobic001G220800--Sobic004G025500 Sobic001G220800--Sobic004G025600 Sobic001G220800--Sobic005G010000 Sobic001G220800--Sobic003G173800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.