Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G088900.1
Synonym SYP124, ATSYP124, Sb04g007360
Functional annotation syntaxin-related protein, putative, expressed
UniProt C5XY01
Pfam PF05739 PF00804
Panther DB PTHR19957 PTHR19957:SF80
NCBI CDD KOG0810; SNARE protein Syntaxin 1 and related proteins
KEGG Orthology K08486; syntaxin 1B/2/3
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G61290 : syntaxin of plants 124
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g39050.1 : syntaxin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051266 , Zm00025a042274 , Zm00025a034586
Brachypodium KQJ94003 , KQJ94002 , KQK17849
Barley HORVU6Hr1G038490.1 , HORVU6Hr1G038490.2 , HORVU6Hr1G038490.3 , HORVU6Hr1G038490.4 , HORVU6Hr1G038490.5 , HORVU6Hr1G038490.6 , HORVU7Hr1G085550.1 , HORVU7Hr1G085550.2 , HORVU6Hr1G038490.7
Wheat TraesCS6A02G182200 , TraesCS6B02G211000 , TraesCS7D02G354500 , TraesCS7A02G368400 , TraesCS6D02G169800 , TraesCS7B02G260100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G088900 Sobic004G088900 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic004G088900--Sobic008G050900 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic004G088900--Sobic005G191200 Sobic006G197900 Sobic006G197900 Sobic004G088900--Sobic006G197900 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic004G088900--Sobic001G144150 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic004G088900--Sobic008G164000 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic004G088900--Sobic003G075300 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic004G088900--Sobic010G012700 Sobic003G391000 Sobic003G391000 Sobic004G088900--Sobic003G391000 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic004G088900--Sobic005G074300 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic008G050900--Sobic001G039100 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic005G074300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic008G050900--Sobic003G133201 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic008G050900--Sobic005G144000 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic008G050900--Sobic005G201501 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic008G050900--Sobic006G070564 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic008G050900--Sobic005G077001 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic008G050900--Sobic002G381500 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G191200--Sobic010G014850 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic005G191200--Sobic003G406060 Sobic005G191200--Sobic003G075300 SobicK028900 SobicK028900 Sobic005G191200--SobicK028900 Sobic005G191200--Sobic001G144150 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G191200--Sobic010G158050 Sobic005G191200--Sobic008G164000 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic005G191200--Sobic005G200100 Sobic005G191200--Sobic010G012700 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic006G197900--Sobic007G081701 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic006G197900--Sobic002G223650 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic006G197900--Sobic006G276801 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic006G197900--Sobic009G177750 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic006G197900--Sobic002G266500 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic006G197900--Sobic004G075250 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic006G197900--Sobic003G250160 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic006G197900--Sobic004G258000 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic006G197900--Sobic001G467400 Sobic001G144150--Sobic005G191200 Sobic001G144150--Sobic010G014850 Sobic001G144150--Sobic003G075300 Sobic001G144150--SobicK028900 Sobic001G144150--Sobic010G158050 Sobic001G144150--Sobic003G406060 Sobic001G144150--Sobic010G012700 Sobic001G144150--Sobic005G201501 Sobic001G144150--Sobic008G164000 Sobic008G164000--Sobic005G191200 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic008G164000--Sobic002G106700 Sobic008G164000--Sobic003G406060 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic008G164000--Sobic008G091785 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic008G164000--Sobic006G230000 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic008G164000--Sobic007G007400 Sobic008G164000--Sobic001G144150 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic008G164000--Sobic001G135650 Sobic008G164000--SobicK028900 Sobic003G075300--Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic010G012700 Sobic003G075300--Sobic005G077001 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic003G075300--Sobic003G191300 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic003G075300--Sobic002G014300 Sobic003G075300--Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic010G014850 Sobic003G075300--Sobic010G158050 Sobic003G075300--Sobic004G258000 Sobic010G012700--Sobic002G014300 Sobic010G012700--Sobic003G075300 Sobic010G012700--Sobic005G201501 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic010G012700--Sobic001G332100 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic003G191300 Sobic010G012700--Sobic005G077001 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic010G012700--Sobic003G428500 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic010G012700--Sobic010G129450 Sobic003G391000--Sobic005G201501 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic003G391000--Sobic007G209900 Sobic003G391000--Sobic005G077001 Sobic003G391000--Sobic003G075300 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic003G391000--Sobic007G112832 Sobic003G391000--Sobic004G258000 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic003G391000--Sobic009G110333 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic003G391000--Sobic004G168150 Sobic003G391000--Sobic002G266500 Sobic005G074300--Sobic008G050900 Sobic005G074300--Sobic001G039100 Sobic005G074300--Sobic010G129450 Sobic005G074300--Sobic002G381500 Sobic005G074300--Sobic003G133201 Sobic004G217100 Sobic004G217100 Sobic005G074300--Sobic004G217100 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic005G074300--Sobic001G414650 Sobic002G382300 Sobic002G382300 Sobic005G074300--Sobic002G382300 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic005G074300--Sobic006G224400
Octagon: transcription factors


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