Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G103500.1
Synonym Sb04g008480
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YNV9
Pfam -
Panther DB PTHR34287 PTHR34287:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G15140 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g13980.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020037
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G046500 protein kinase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G086200 PHD finger protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G085400 acyl-activating enzyme 14, putative, expressed -
4 Sobic.004G083700 expressed protein -
5 Sobic.010G005600 SEC14 cytosolic factor family protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G114700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
7 Sobic.003G372100 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
8 Sobic.006G000700 - -
9 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
10 Sobic.010G111800 no apical meristem protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G069400 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.010G075700 - -
13 Sobic.001G211800 - -
14 Sobic.004G031400 protein kinase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G070100 expressed protein -
16 Sobic.002G209600 CBS domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G147200 - -
18 Sobic.010G146600 cyclin-dependent kinase F-1, putative, expressed -
19 Sobic.006G214400 peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases, putative, expressed -
20 Sobic.004G113800 CAPIP1, putative, expressed K14496: abscisic acid receptor PYR/PYL family


Gene co-expression network
sample Sobic004G103500 Sobic004G103500 Sobic005G046500 Sobic005G046500 Sobic004G103500--Sobic005G046500 Sobic005G086200 Sobic005G086200 Sobic004G103500--Sobic005G086200 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic004G103500--Sobic009G085400 Sobic004G083700 Sobic004G083700 Sobic004G103500--Sobic004G083700 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic004G103500--Sobic010G005600 Sobic002G114700 Sobic002G114700 Sobic004G103500--Sobic002G114700 Sobic003G372100 Sobic003G372100 Sobic004G103500--Sobic003G372100 Sobic006G000700 Sobic006G000700 Sobic004G103500--Sobic006G000700 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic004G103500--Sobic007G052900 Sobic003G178700 Sobic003G178700 Sobic005G046500--Sobic003G178700 Sobic005G046500--Sobic009G085400 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic005G046500--Sobic009G004700 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic005G046500--Sobic006G214400 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic005G046500--Sobic006G180432 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic005G046500--Sobic009G045700 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic005G046500--Sobic001G497200 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic005G046500--Sobic009G078500 Sobic009G002500 Sobic009G002500 Sobic005G046500--Sobic009G002500 Sobic004G087600 Sobic004G087600 Sobic005G086200--Sobic004G087600 Sobic010G146600 Sobic010G146600 Sobic005G086200--Sobic010G146600 Sobic009G225200 Sobic009G225200 Sobic005G086200--Sobic009G225200 Sobic005G086200--Sobic009G085400 Sobic002G317300 Sobic002G317300 Sobic005G086200--Sobic002G317300 Sobic004G211400 Sobic004G211400 Sobic005G086200--Sobic004G211400 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic005G086200--Sobic002G336800 Sobic005G086200--Sobic004G083700 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic005G086200--Sobic008G011100 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic009G085400--Sobic003G416100 Sobic010G248600 Sobic010G248600 Sobic009G085400--Sobic010G248600 Sobic009G085400--Sobic006G214400 Sobic009G085400--Sobic002G114700 Sobic003G106200 Sobic003G106200 Sobic009G085400--Sobic003G106200 Sobic009G085400--Sobic005G046500 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic009G085400--Sobic004G035000 Sobic007G002000 Sobic007G002000 Sobic009G085400--Sobic007G002000 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic009G085400--Sobic005G173366 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic004G083700--Sobic010G056200 Sobic004G083700--Sobic007G052900 Sobic007G108500 Sobic007G108500 Sobic004G083700--Sobic007G108500 Sobic003G309900 Sobic003G309900 Sobic004G083700--Sobic003G309900 Sobic002G309800 Sobic002G309800 Sobic004G083700--Sobic002G309800 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic004G083700--Sobic010G280100 Sobic001G291100 Sobic001G291100 Sobic004G083700--Sobic001G291100 Sobic002G122600 Sobic002G122600 Sobic004G083700--Sobic002G122600 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic004G083700--Sobic009G198900 Sobic010G005600--Sobic007G052900 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic010G005600--Sobic010G176550 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic010G005600--Sobic002G031400 Sobic001G159400 Sobic001G159400 Sobic010G005600--Sobic001G159400 Sobic004G174400 Sobic004G174400 Sobic010G005600--Sobic004G174400 Sobic009G215800 Sobic009G215800 Sobic010G005600--Sobic009G215800 Sobic002G351900 Sobic002G351900 Sobic010G005600--Sobic002G351900 Sobic001G384900 Sobic001G384900 Sobic010G005600--Sobic001G384900 Sobic010G005600--Sobic010G056200 Sobic008G078900 Sobic008G078900 Sobic002G114700--Sobic008G078900 Sobic003G114100 Sobic003G114100 Sobic002G114700--Sobic003G114100 Sobic006G273400 Sobic006G273400 Sobic002G114700--Sobic006G273400 Sobic001G076200 Sobic001G076200 Sobic002G114700--Sobic001G076200 Sobic003G110700 Sobic003G110700 Sobic002G114700--Sobic003G110700 Sobic007G069400 Sobic007G069400 Sobic002G114700--Sobic007G069400 Sobic002G114700--Sobic006G214400 Sobic002G114700--Sobic004G035000 Sobic007G205600 Sobic007G205600 Sobic002G114700--Sobic007G205600 Sobic009G101400 Sobic009G101400 Sobic003G372100--Sobic009G101400 Sobic007G168200 Sobic007G168200 Sobic003G372100--Sobic007G168200 Sobic003G078800 Sobic003G078800 Sobic003G372100--Sobic003G078800 Sobic001G294200 Sobic001G294200 Sobic003G372100--Sobic001G294200 Sobic003G103200 Sobic003G103200 Sobic003G372100--Sobic003G103200 Sobic001G479200 Sobic001G479200 Sobic003G372100--Sobic001G479200 Sobic006G269000 Sobic006G269000 Sobic003G372100--Sobic006G269000 Sobic001G129300 Sobic001G129300 Sobic003G372100--Sobic001G129300 Sobic001G208300 Sobic001G208300 Sobic003G372100--Sobic001G208300 Sobic004G253100 Sobic004G253100 Sobic006G000700--Sobic004G253100 Sobic003G196900 Sobic003G196900 Sobic006G000700--Sobic003G196900 Sobic009G050900 Sobic009G050900 Sobic006G000700--Sobic009G050900 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic006G000700--Sobic001G219600 Sobic010G053600 Sobic010G053600 Sobic006G000700--Sobic010G053600 Sobic009G017400 Sobic009G017400 Sobic006G000700--Sobic009G017400 Sobic009G047200 Sobic009G047200 Sobic006G000700--Sobic009G047200 Sobic002G313400 Sobic002G313400 Sobic006G000700--Sobic002G313400 Sobic006G000700--Sobic008G011100 Sobic007G052900--Sobic010G056200 Sobic004G113800 Sobic004G113800 Sobic007G052900--Sobic004G113800 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic007G052900--Sobic002G209600 Sobic007G052900--Sobic010G005600 Sobic007G052900--Sobic004G083700 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic007G052900--Sobic007G054000 Sobic007G052900--Sobic010G280100 Sobic007G052900--Sobic006G180432 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic007G052900--Sobic009G065100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.