Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G319100.1
Synonym Sb04g034990
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XTN0
Pfam -
Panther DB PTHR34788 PTHR34788:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14060 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g53870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022351
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G030400 expressed protein -
2 Sobic.001G238400 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.006G132900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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11 Sobic.003G364950 - -
12 Sobic.010G043900 expressed protein -
13 Sobic.008G158666 - -
14 Sobic.005G005600 prenylated rab acceptor, putative, expressed -
15 Sobic.010G271300 carrier, putative, expressed -
16 Sobic.004G292900 LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.006G234800 expressed protein -
18 Sobic.001G237900 expansin precursor, putative, expressed -
19 Sobic.001G063200 VQ domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G348500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G319100 Sobic004G319100 Sobic007G030400 Sobic007G030400 Sobic004G319100--Sobic007G030400 Sobic001G238400 Sobic001G238400 Sobic004G319100--Sobic001G238400 Sobic006G132900 Sobic006G132900 Sobic004G319100--Sobic006G132900 Sobic005G213500 Sobic005G213500 Sobic004G319100--Sobic005G213500 Sobic007G039600 Sobic007G039600 Sobic004G319100--Sobic007G039600 Sobic004G318700 Sobic004G318700 Sobic004G319100--Sobic004G318700 Sobic002G183600 Sobic002G183600 Sobic004G319100--Sobic002G183600 Sobic008G020100 Sobic008G020100 Sobic004G319100--Sobic008G020100 Sobic010G259500 Sobic010G259500 Sobic004G319100--Sobic010G259500 Sobic007G030400--Sobic007G039600 Sobic008G170100 Sobic008G170100 Sobic007G030400--Sobic008G170100 Sobic007G030400--Sobic005G213500 Sobic010G085500 Sobic010G085500 Sobic007G030400--Sobic010G085500 Sobic007G030400--Sobic004G319100 Sobic007G030400--Sobic010G259500 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic007G030400--Sobic010G043900 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic007G030400--Sobic003G364950 Sobic003G364000 Sobic003G364000 Sobic007G030400--Sobic003G364000 Sobic001G304100 Sobic001G304100 Sobic001G238400--Sobic001G304100 Sobic001G237900 Sobic001G237900 Sobic001G238400--Sobic001G237900 Sobic003G007600 Sobic003G007600 Sobic001G238400--Sobic003G007600 Sobic009G188000 Sobic009G188000 Sobic001G238400--Sobic009G188000 Sobic001G238400--Sobic004G318700 Sobic003G299300 Sobic003G299300 Sobic001G238400--Sobic003G299300 Sobic004G292900 Sobic004G292900 Sobic001G238400--Sobic004G292900 Sobic006G234800 Sobic006G234800 Sobic001G238400--Sobic006G234800 Sobic001G238400--Sobic006G132900 Sobic001G502400 Sobic001G502400 Sobic006G132900--Sobic001G502400 Sobic006G132900--Sobic006G234800 Sobic005G107900 Sobic005G107900 Sobic006G132900--Sobic005G107900 Sobic001G313600 Sobic001G313600 Sobic006G132900--Sobic001G313600 Sobic002G188900 Sobic002G188900 Sobic006G132900--Sobic002G188900 Sobic006G132900--Sobic001G304100 Sobic001G435000 Sobic001G435000 Sobic006G132900--Sobic001G435000 Sobic004G229800 Sobic004G229800 Sobic006G132900--Sobic004G229800 Sobic006G132900--Sobic001G238400 Sobic010G156500 Sobic010G156500 Sobic005G213500--Sobic010G156500 Sobic005G213500--Sobic003G364000 Sobic005G213600 Sobic005G213600 Sobic005G213500--Sobic005G213600 Sobic003G364300 Sobic003G364300 Sobic005G213500--Sobic003G364300 Sobic005G213500--Sobic006G132900 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic005G213500--Sobic002G338500 Sobic005G213500--Sobic010G043900 Sobic005G213500--Sobic010G259500 Sobic005G005600 Sobic005G005600 Sobic005G213500--Sobic005G005600 Sobic007G039600--Sobic010G259500 Sobic001G365100 Sobic001G365100 Sobic007G039600--Sobic001G365100 Sobic007G039600--Sobic007G030400 Sobic007G039600--Sobic004G229800 Sobic003G307801 Sobic003G307801 Sobic007G039600--Sobic003G307801 Sobic008G158666 Sobic008G158666 Sobic007G039600--Sobic008G158666 Sobic005G051500 Sobic005G051500 Sobic007G039600--Sobic005G051500 Sobic001G018300 Sobic001G018300 Sobic007G039600--Sobic001G018300 Sobic003G265000 Sobic003G265000 Sobic007G039600--Sobic003G265000 Sobic001G416200 Sobic001G416200 Sobic004G318700--Sobic001G416200 Sobic004G318700--Sobic001G238400 Sobic004G318700--Sobic001G304100 Sobic001G161500 Sobic001G161500 Sobic004G318700--Sobic001G161500 Sobic002G213600 Sobic002G213600 Sobic004G318700--Sobic002G213600 Sobic004G318700--Sobic009G188000 Sobic004G318700--Sobic001G237900 Sobic004G349125 Sobic004G349125 Sobic004G318700--Sobic004G349125 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic004G318700--Sobic004G202400 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic002G183600--Sobic008G157800 Sobic001G348500 Sobic001G348500 Sobic002G183600--Sobic001G348500 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic002G183600--Sobic004G292001 Sobic002G183600--Sobic005G213500 Sobic002G183600--Sobic005G005600 Sobic002G183600--Sobic007G030400 Sobic002G183600--Sobic004G319100 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic002G183600--Sobic004G061701 Sobic006G019200 Sobic006G019200 Sobic002G183600--Sobic006G019200 Sobic008G020100--Sobic006G132900 Sobic001G433900 Sobic001G433900 Sobic008G020100--Sobic001G433900 Sobic008G020100--Sobic004G318700 Sobic009G106400 Sobic009G106400 Sobic008G020100--Sobic009G106400 Sobic010G271300 Sobic010G271300 Sobic008G020100--Sobic010G271300 Sobic008G020100--Sobic004G319100 Sobic009G088900 Sobic009G088900 Sobic008G020100--Sobic009G088900 Sobic007G169900 Sobic007G169900 Sobic008G020100--Sobic007G169900 Sobic008G020100--Sobic009G188000 Sobic010G259500--Sobic001G365100 Sobic001G402200 Sobic001G402200 Sobic010G259500--Sobic001G402200 Sobic010G259500--Sobic007G039600 Sobic010G259500--Sobic003G364000 Sobic007G155100 Sobic007G155100 Sobic010G259500--Sobic007G155100 Sobic010G259500--Sobic003G307801 Sobic010G066700 Sobic010G066700 Sobic010G259500--Sobic010G066700 Sobic010G088700 Sobic010G088700 Sobic010G259500--Sobic010G088700 Sobic010G259500--Sobic005G051500
Octagon: transcription factors


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