Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G346750.1,Sobic.004G346750.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQW4 , A0A1Z5RQK1
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g02090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G090700 expressed protein -
2 Sobic.003G141600 - -
3 Sobic.008G098700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pumilio-family RNA binding repeat containing protein, expressed -
4 Sobic.007G048900 OsFBX381 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G078300 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G106000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G414100 expressed protein -
8 Sobic.002G158300 ankyrin, putative, expressed -
9 Sobic.003G342500 methyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.007G216800 expressed protein -
11 Sobic.002G368100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@COBRA, putative, expressed -
12 Sobic.003G435400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
13 Sobic.004G032600 - -
14 Sobic.004G098800 - -
15 Sobic.003G392275 - -
16 Sobic.001G490950 - -
17 Sobic.005G171900 expressed protein -
18 Sobic.002G106200 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G226900 zinc finger family protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G199700 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14


Gene co-expression network
sample Sobic004G346750 Sobic004G346750 Sobic010G090700 Sobic010G090700 Sobic004G346750--Sobic010G090700 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic004G346750--Sobic003G141600 Sobic008G098700 Sobic008G098700 Sobic004G346750--Sobic008G098700 Sobic007G048900 Sobic007G048900 Sobic004G346750--Sobic007G048900 Sobic005G078300 Sobic005G078300 Sobic004G346750--Sobic005G078300 Sobic002G106000 Sobic002G106000 Sobic004G346750--Sobic002G106000 Sobic001G414100 Sobic001G414100 Sobic004G346750--Sobic001G414100 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic004G346750--Sobic002G158300 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic004G346750--Sobic003G342500 Sobic010G090700--Sobic004G346750 Sobic010G090700--Sobic008G098700 Sobic006G181500 Sobic006G181500 Sobic010G090700--Sobic006G181500 Sobic006G215800 Sobic006G215800 Sobic010G090700--Sobic006G215800 Sobic010G090700--Sobic007G048900 Sobic002G299200 Sobic002G299200 Sobic010G090700--Sobic002G299200 Sobic003G270100 Sobic003G270100 Sobic010G090700--Sobic003G270100 Sobic002G106200 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Octagon: transcription factors


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