Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G171900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PT21
Pfam -
Panther DB PTHR33110 PTHR33110:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g38250.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G203000 cytochrome P450, putative, expressed K15402: fatty acid omega-hydroxylase
2 Sobic.001G242200 MBTB35 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
3 Sobic.005G070301 - K03007: RPB10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
4 Sobic.009G240500 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G013550 - K08770: ubiquitin C
6 Sobic.001G485000 expressed protein -
7 Sobic.001G218600 MATH domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G080800 oxidoreductase, putative, expressed K00472: prolyl 4-hydroxylase
9 Sobic.008G041300 - K14777: DDX47, ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
10 Sobic.007G144100 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
11 Sobic.003G027000 OsMADS3 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
12 Sobic.009G017600 cupin domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G258100 dynamin family protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G097200 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G356850 - -
16 Sobic.008G056800 expressed protein -
17 Sobic.003G090400 seven in absentia protein family protein, expressed -
18 Sobic.003G018000 expressed protein -
19 Sobic.003G090200 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G100300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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