Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G018600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPM6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G042800 - -
2 Sobic.006G272400 tentative name(PubMedID : 31536532)@core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed -
3 Sobic.008G102850 - -
4 Sobic.005G044600 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G158100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
6 Sobic.007G134260 - -
7 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
8 Sobic.005G122100 expressed protein -
9 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G114800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G090400 - -
13 Sobic.009G089000 ATCHX, putative, expressed -
14 Sobic.004G091000 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
15 Sobic.005G009700 expressed protein -
16 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
17 Sobic.009G089200 NAD dependent epimerase/dehydratase family domain containing protein, expressed K12450: UDP-glucose 4,6-dehydratase
18 Sobic.002G157900 - -
19 Sobic.003G232100 - -
20 Sobic.006G270800 EF hand family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G018600 Sobic005G018600 Sobic003G042800 Sobic003G042800 Sobic005G018600--Sobic003G042800 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic005G018600--Sobic006G272400 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G018600--Sobic008G102850 Sobic005G044600 Sobic005G044600 Sobic005G018600--Sobic005G044600 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G018600--Sobic004G158100 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G018600--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic005G018600--Sobic007G103000 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic005G018600--Sobic005G122100 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic005G018600--Sobic005G065300 Sobic003G042800--Sobic008G102850 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic003G042800--Sobic005G214700 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic003G042800--Sobic009G090400 Sobic003G042800--Sobic005G122100 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic003G042800--Sobic002G157900 Sobic003G042800--Sobic007G103000 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic003G042800--Sobic007G222200 Sobic003G042800--Sobic007G134260 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic003G042800--Sobic001G024300 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic006G272400--Sobic001G202900 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic006G272400--Sobic009G165900 Sobic006G272400--Sobic004G158100 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic006G272400--Sobic001G222800 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic006G272400--Sobic008G075800 Sobic003G286000 Sobic003G286000 Sobic006G272400--Sobic003G286000 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic006G272400--Sobic004G336401 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic006G272400--Sobic008G097800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic006G272400--Sobic002G145400 Sobic008G102850--Sobic007G103000 Sobic008G102850--Sobic007G134260 Sobic008G102850--Sobic005G214700 Sobic008G102850--Sobic005G122100 Sobic008G102850--Sobic005G065300 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic008G102850--Sobic003G147700 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic008G102850--Sobic004G091000 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic008G102850--Sobic003G114800 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic008G102850--Sobic003G232100 Sobic008G043400 Sobic008G043400 Sobic005G044600--Sobic008G043400 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic005G044600--Sobic005G031700 Sobic010G230200 Sobic010G230200 Sobic005G044600--Sobic010G230200 Sobic001G511100 Sobic001G511100 Sobic005G044600--Sobic001G511100 Sobic003G197500 Sobic003G197500 Sobic005G044600--Sobic003G197500 Sobic003G114900 Sobic003G114900 Sobic005G044600--Sobic003G114900 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic005G044600--Sobic009G116100 Sobic002G427500 Sobic002G427500 Sobic005G044600--Sobic002G427500 Sobic009G089000 Sobic009G089000 Sobic005G044600--Sobic009G089000 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic007G134260--Sobic007G103000 Sobic007G134260--Sobic005G122100 Sobic007G134260--Sobic004G091000 Sobic007G134260--Sobic003G232100 Sobic007G134260--Sobic003G114800 Sobic007G134260--Sobic003G147700 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic007G134260--Sobic006G270800 Sobic007G134260--Sobic008G102850 Sobic007G134260--Sobic009G090400 Sobic007G103000--Sobic007G134260 Sobic007G103000--Sobic005G122100 Sobic007G103000--Sobic004G091000 Sobic007G103000--Sobic003G232100 Sobic007G103000--Sobic003G147700 Sobic007G103000--Sobic003G114800 Sobic007G103000--Sobic008G102850 Sobic007G103000--Sobic006G270800 Sobic007G103000--Sobic009G090400 Sobic005G122100--Sobic009G090400 Sobic005G122100--Sobic007G103000 Sobic005G122100--Sobic007G134260 Sobic005G122100--Sobic007G222200 Sobic005G122100--Sobic006G270800 Sobic005G122100--Sobic003G232100 Sobic005G122100--Sobic002G157900 Sobic005G122100--Sobic003G147700 Sobic005G122100--Sobic002G427500 Sobic009G089200 Sobic009G089200 Sobic005G065300--Sobic009G089200 Sobic005G065300--Sobic007G103000 Sobic005G065300--Sobic007G134260 Sobic005G065300--Sobic008G102850 Sobic005G065300--Sobic003G114800 Sobic005G065300--Sobic004G091000 Sobic005G065300--Sobic005G122100 Sobic005G065300--Sobic003G147700 Sobic005G065300--Sobic003G232100
Octagon: transcription factors


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