Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G042900.1
Synonym Sb05g003560
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y529
Pfam -
Panther DB PTHR34569 PTHR34569:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033536
Brachypodium PNT68066 , KQJ98204 , PNT68064 , PNT68065 , PNT68063 , KQJ98203 , PNT68067 , KQJ98205 , KQJ92172
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G272400 tentative name(PubMedID : 31536532)@core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed -
2 Sobic.001G202900 expressed protein -
3 Sobic.003G286000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G165900 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G158100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
6 Sobic.001G024700 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G364700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G222800 expressed protein -
9 Sobic.008G075800 - -
10 Sobic.007G222700 - -
11 Sobic.007G061800 transporter family protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G118800 - -
13 Sobic.005G044600 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G336401 - -
15 Sobic.009G166000 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
17 Sobic.002G145400 octicosapeptide/Phox/Bem1p, putative, expressed -
18 Sobic.004G331500 similar to Cation-transporting ATPase(PubMedID : 29862293)@ATPase 8, plasma membrane-type, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
19 Sobic.003G195400 - -
20 Sobic.004G287200 OsSub26 - Putative Subtilisin homologue, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic005G042900--Sobic006G272400 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic005G042900--Sobic001G202900 Sobic003G286000 Sobic003G286000 Sobic005G042900--Sobic003G286000 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic005G042900--Sobic009G165900 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G042900--Sobic004G158100 Sobic001G024700 Sobic001G024700 Sobic005G042900--Sobic001G024700 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic005G042900--Sobic001G364700 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic005G042900--Sobic001G222800 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic005G042900--Sobic008G075800 Sobic006G272400--Sobic001G202900 Sobic006G272400--Sobic009G165900 Sobic006G272400--Sobic004G158100 Sobic006G272400--Sobic001G222800 Sobic006G272400--Sobic008G075800 Sobic006G272400--Sobic003G286000 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic006G272400--Sobic004G336401 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic006G272400--Sobic008G097800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic006G272400--Sobic002G145400 Sobic001G202900--Sobic009G165900 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic001G202900--Sobic004G331500 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic001G202900--Sobic010G034300 Sobic001G202900--Sobic004G336401 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic001G202900--Sobic010G254100 Sobic001G202900--Sobic008G097800 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic001G202900--Sobic009G166000 Sobic001G202900--Sobic008G075800 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic001G202900--Sobic004G287200 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G286000--Sobic004G024800 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G286000--Sobic001G539880 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic003G286000--Sobic007G148233 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic003G286000--Sobic003G195400 Sobic003G286000--Sobic004G158100 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic003G286000--Sobic002G225800 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic003G286000--Sobic005G035250 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic003G286000--Sobic008G011901 Sobic003G286000--Sobic001G364700 Sobic009G165900--Sobic004G331500 Sobic009G165900--Sobic004G336401 Sobic009G165900--Sobic010G254100 Sobic009G165900--Sobic008G075800 Sobic009G165900--Sobic001G202900 Sobic009G165900--Sobic009G166000 Sobic009G165900--Sobic008G097800 Sobic009G165900--Sobic010G034300 Sobic009G165900--Sobic004G287200 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic001G024700--Sobic005G009700 Sobic001G024700--Sobic005G000200 Sobic001G024700--Sobic004G158100 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic001G024700--Sobic004G091000 Sobic001G024700--Sobic001G539820 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic001G024700--Sobic003G114800 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic001G024700--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic001G024700--Sobic007G103000 Sobic001G024700--Sobic001G139400 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic005G000200 Sobic001G364700--Sobic001G539820 Sobic001G364700--Sobic005G009700 Sobic001G364700--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic002G128700 Sobic001G364700--Sobic003G114800 Sobic001G364700--Sobic002G225800 Sobic001G222800--Sobic008G075800 Sobic001G222800--Sobic007G061800 Sobic001G222800--Sobic010G118800 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic001G222800--Sobic010G177600 Sobic001G222800--Sobic004G287200 Sobic001G222800--Sobic007G222700 Sobic001G222800--Sobic001G364700 Sobic001G222800--Sobic004G331500 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic001G222800--Sobic006G234400 Sobic008G075800--Sobic007G061800 Sobic008G075800--Sobic001G222800 Sobic008G075800--Sobic010G118800 Sobic008G075800--Sobic010G177600 Sobic008G075800--Sobic004G331500 Sobic008G075800--Sobic009G166000 Sobic008G075800--Sobic004G287200 Sobic008G075800--Sobic007G222700 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic008G075800--Sobic010G034200
Octagon: transcription factors


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