Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G128700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PS45
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G472200 pumilio-family RNA binding repeat containing protein, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
2 Sobic.008G154900 expressed protein -
3 Sobic.002G039900 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@- -
4 Sobic.007G064700 - -
5 Sobic.002G404300 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
6 Sobic.006G274000 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
7 Sobic.006G015900 thaumatin, putative, expressed -
8 Sobic.004G045500 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
9 Sobic.008G176200 - -
10 Sobic.003G274900 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.003G347100 - -
12 Sobic.003G072400 expressed protein -
13 Sobic.001G207600 white-brown complex homolog protein 11, putative, expressed -
14 Sobic.003G278900 strictosidine synthase, putative, expressed -
15 Sobic.003G298700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
16 Sobic.010G009100 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G335900 cyclin, putative, expressed K18812: cyclin D6, plant
18 Sobic.004G283800 dehydration response related protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G215400 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
20 Sobic.009G174100 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G128700 Sobic005G128700 Sobic001G472200 Sobic001G472200 Sobic005G128700--Sobic001G472200 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic005G128700--Sobic008G154900 Sobic002G039900 Sobic002G039900 Sobic005G128700--Sobic002G039900 Sobic007G064700 Sobic007G064700 Sobic005G128700--Sobic007G064700 Sobic002G404300 Sobic002G404300 Sobic005G128700--Sobic002G404300 Sobic006G274000 Sobic006G274000 Sobic005G128700--Sobic006G274000 Sobic006G015900 Sobic006G015900 Sobic005G128700--Sobic006G015900 Sobic004G045500 Sobic004G045500 Sobic005G128700--Sobic004G045500 Sobic008G176200 Sobic008G176200 Sobic005G128700--Sobic008G176200 Sobic008G013400 Sobic008G013400 Sobic001G472200--Sobic008G013400 Sobic001G472200--Sobic008G154900 Sobic008G155900 Sobic008G155900 Sobic001G472200--Sobic008G155900 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic001G472200--Sobic006G005800 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic001G472200--Sobic003G090650 Sobic004G309700 Sobic004G309700 Sobic001G472200--Sobic004G309700 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Octagon: transcription factors


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