Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G222100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PU50
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G123600 WW domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G008800 WD domain and HEAT domain containing protein, putative, expressed K07204: regulatory associated protein of mTOR
3 Sobic.003G170900 - -
4 Sobic.001G456900 expressed protein -
5 Sobic.007G110700 serine/threonine-protein kinase PRP4, putative, expressed K08827: serine/threonine-protein kinase PRP4
6 Sobic.009G132700 - -
7 Sobic.007G159900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
8 Sobic.007G157000 protein transport protein, putative, expressed K14006: protein transport protein SEC23
9 Sobic.009G109200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed K07203: MTOR, FRAP, serine/threonine-protein kinase mTOR
10 Sobic.009G256300 DNA binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G036050 - -
12 Sobic.005G167700 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
13 Sobic.010G112100 transcription factor jumonji, putative, expressed K11446: KDM5, [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
14 Sobic.009G024400 ZOS5-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed K09191: general transcription factor IIIA
15 Sobic.001G241200 protein kinase domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G168100 BZIP protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G139000 surp module family protein, putative, expressed K13123: G patch domain-containing protein 1
18 Sobic.003G389200 Rad21 / Rec8 like protein, putative, expressed K06670: SCC1, MCD1, cohesin complex subunit SCC1
19 Sobic.003G408600 GYF domain containing protein, putative, expressed K18730: PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein
20 Sobic.010G010700 PHD-finger family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G222100 Sobic005G222100 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic005G222100--Sobic010G123600 Sobic005G008800 Sobic005G008800 Sobic005G222100--Sobic005G008800 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic005G222100--Sobic003G170900 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic005G222100--Sobic001G456900 Sobic007G110700 Sobic007G110700 Sobic005G222100--Sobic007G110700 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic005G222100--Sobic009G132700 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic005G222100--Sobic007G159900 Sobic007G157000 Sobic007G157000 Sobic005G222100--Sobic007G157000 Sobic009G109200 Sobic009G109200 Sobic005G222100--Sobic009G109200 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic010G123600--Sobic010G010700 Sobic009G256300 Sobic009G256300 Sobic010G123600--Sobic009G256300 Sobic010G123600--Sobic003G170900 Sobic005G167700 Sobic005G167700 Sobic010G123600--Sobic005G167700 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic010G123600--Sobic005G112300 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic010G123600--Sobic001G433800 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic010G123600--Sobic010G112100 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic010G123600--Sobic001G194200 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic010G123600--Sobic008G001200 Sobic001G540400 Sobic001G540400 Sobic005G008800--Sobic001G540400 Sobic003G408600 Sobic003G408600 Sobic005G008800--Sobic003G408600 Sobic005G008800--Sobic005G112300 Sobic007G062800 Sobic007G062800 Sobic005G008800--Sobic007G062800 Sobic001G289600 Sobic001G289600 Sobic005G008800--Sobic001G289600 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic005G008800--Sobic004G314000 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic005G008800--Sobic008G009700 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic005G008800--Sobic001G289800 Sobic005G008800--Sobic009G109200 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic003G170900--Sobic009G165700 Sobic003G170900--Sobic010G123600 Sobic003G170900--Sobic005G112300 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic003G170900--Sobic010G206900 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic003G170900--Sobic010G139000 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic003G170900--Sobic003G422500 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic003G170900--Sobic003G166750 Sobic010G247800 Sobic010G247800 Sobic003G170900--Sobic010G247800 Sobic003G170900--Sobic001G194200 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic001G456900--Sobic001G036050 Sobic001G456900--Sobic010G139000 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic001G456900--Sobic004G258700 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic001G456900--Sobic008G113100 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic001G456900--Sobic008G028700 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic001G456900--Sobic002G180666 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic001G456900--Sobic001G311500 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic001G456900--Sobic003G398700 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic001G456900--Sobic003G101500 Sobic007G110700--Sobic005G222100 Sobic001G300100 Sobic001G300100 Sobic007G110700--Sobic001G300100 Sobic003G217900 Sobic003G217900 Sobic007G110700--Sobic003G217900 Sobic007G110700--Sobic003G398700 Sobic007G110700--Sobic007G159900 Sobic010G021500 Sobic010G021500 Sobic007G110700--Sobic010G021500 Sobic007G110700--Sobic001G456900 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic007G110700--Sobic003G168100 Sobic007G110700--Sobic005G008800 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic009G132700--Sobic005G027400 Sobic004G140600 Sobic004G140600 Sobic009G132700--Sobic004G140600 Sobic009G132700--Sobic003G170900 Sobic001G455600 Sobic001G455600 Sobic009G132700--Sobic001G455600 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic009G132700--Sobic002G211800 Sobic006G252900 Sobic006G252900 Sobic009G132700--Sobic006G252900 Sobic009G132700--Sobic001G433800 Sobic001G111850 Sobic001G111850 Sobic009G132700--Sobic001G111850 Sobic003G188400 Sobic003G188400 Sobic009G132700--Sobic003G188400 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic007G159900--Sobic003G360400 Sobic004G158400 Sobic004G158400 Sobic007G159900--Sobic004G158400 Sobic002G366400 Sobic002G366400 Sobic007G159900--Sobic002G366400 Sobic007G159900--Sobic010G112100 Sobic007G183900 Sobic007G183900 Sobic007G159900--Sobic007G183900 Sobic005G064000 Sobic005G064000 Sobic007G159900--Sobic005G064000 Sobic005G100700 Sobic005G100700 Sobic007G159900--Sobic005G100700 Sobic007G159900--Sobic003G188400 Sobic007G159900--Sobic008G113100 Sobic007G157000--Sobic010G139000 Sobic007G157000--Sobic001G311500 Sobic007G157000--Sobic010G112100 Sobic007G157000--Sobic005G008800 Sobic007G157000--Sobic004G314000 Sobic007G157000--Sobic009G109200 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic007G157000--Sobic001G219600 Sobic002G397500 Sobic002G397500 Sobic007G157000--Sobic002G397500 Sobic007G157000--Sobic003G408600 Sobic010G105200 Sobic010G105200 Sobic009G109200--Sobic010G105200 Sobic004G242400 Sobic004G242400 Sobic009G109200--Sobic004G242400 Sobic009G109200--Sobic002G397500 Sobic001G542400 Sobic001G542400 Sobic009G109200--Sobic001G542400 Sobic009G109200--Sobic001G540400 Sobic009G109200--Sobic005G008800 Sobic004G276400 Sobic004G276400 Sobic009G109200--Sobic004G276400 Sobic009G109200--Sobic003G408600 Sobic009G109200--Sobic010G112100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.