Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G090700.2,Sobic.006G090700.1
Synonym Sb06g017580, FRS11
Functional annotation FAR1 family protein, expressed
UniProt C5Y8V9
Pfam PF04434 PF03101 PF10551
Panther DB PTHR31669 PTHR31669:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G10240 : FAR1-related sequence 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g36590.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ82841 , KQJ82842 , PNT61182 , PNT61183 , PNT61180 , PNT61181
Barley HORVU2Hr1G077100.3 , HORVU2Hr1G077100.2 , HORVU2Hr1G077100.1 , HORVU2Hr1G077100.7 , HORVU2Hr1G077100.5 , HORVU2Hr1G077100.4 , HORVU2Hr1G077100.9 , HORVU2Hr1G077100.13 , HORVU2Hr1G077100.12 , HORVU2Hr1G077100.16 , HORVU2Hr1G077100.15 , HORVU2Hr1G077100.14
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G084700 - -
2 Sobic.003G406300 - -
3 Sobic.003G438400 expressed protein -
4 Sobic.003G180900 SLT1 protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G452000 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
6 Sobic.001G251700 OsPP2Ac-4 - Phosphatase 2A isoform 4 belonging to family 2, expressed K04382: serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit
7 Sobic.001G512700 myb/SANT domain protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G007100 - -
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10 Sobic.005G013200 BAH domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G145101 - -
12 Sobic.003G176500 - -
13 Sobic.006G116100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G176400 - -
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16 Sobic.002G243900 - -
17 Sobic.001G347300 splicing factor, arginine/serine-rich 16, putative, expressed K13168: splicing factor, arginine/serine-rich 16
18 Sobic.002G297200 ZOS9-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.006G173100 pre-mRNA-processing factor 31, putative, expressed K12844: U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP31
20 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5


Gene co-expression network
sample Sobic006G090700 Sobic006G090700 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic006G090700--Sobic008G084700 Sobic003G406300 Sobic003G406300 Sobic006G090700--Sobic003G406300 Sobic003G438400 Sobic003G438400 Sobic006G090700--Sobic003G438400 Sobic003G180900 Sobic003G180900 Sobic006G090700--Sobic003G180900 Sobic001G452000 Sobic001G452000 Sobic006G090700--Sobic001G452000 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic006G090700--Sobic001G251700 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic006G090700--Sobic001G512700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic006G090700--Sobic004G007100 Sobic002G353600 Sobic002G353600 Sobic006G090700--Sobic002G353600 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic008G084700--Sobic009G104201 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic008G084700--Sobic003G372700 Sobic005G118600 Sobic005G118600 Sobic008G084700--Sobic005G118600 Sobic008G084700--Sobic004G007100 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic008G084700--Sobic009G086900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic008G084700--Sobic002G180666 Sobic006G032500 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Sobic002G264200 Sobic002G353600--Sobic002G264200 Sobic002G353600--Sobic003G059750 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic002G353600--Sobic001G206100 Sobic004G257400 Sobic004G257400 Sobic002G353600--Sobic004G257400 Sobic002G353600--Sobic003G445400
Octagon: transcription factors


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