Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G180900.1
Synonym Sb03g023766, SLT1
Functional annotation SLT1 protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q420
Pfam -
Panther DB PTHR33981
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37570 : HSP20-like chaperones superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g62300.1 : SLT1 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026919
Brachypodium KQK10508
Barley HORVU3Hr1G086480.3 , HORVU3Hr1G086480.1 , HORVU3Hr1G086480.7 , HORVU3Hr1G086480.6 , HORVU3Hr1G086480.5 , HORVU3Hr1G086480.9 , HORVU3Hr1G086480.8 , HORVU3Hr1G086480.11 , HORVU3Hr1G086480.10 , HORVU3Hr1G086480.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G084700 - -
2 Sobic.006G116100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G118600 NB-ARC domain containing protein, expressed -
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9 Sobic.006G032500 - -
10 Sobic.001G363500 DIRP family protein, putative, expressed -
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20 Sobic.007G218000 chloride transporter, chloride channel family, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G180900 Sobic003G180900 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic003G180900--Sobic008G084700 Sobic006G116100 Sobic006G116100 Sobic003G180900--Sobic006G116100 Sobic005G118600 Sobic005G118600 Sobic003G180900--Sobic005G118600 Sobic003G444800 Sobic003G444800 Sobic003G180900--Sobic003G444800 Sobic009G119000 Sobic009G119000 Sobic003G180900--Sobic009G119000 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic003G180900--Sobic003G059750 SobicK028600 SobicK028600 Sobic003G180900--SobicK028600 Sobic002G299700 Sobic002G299700 Sobic003G180900--Sobic002G299700 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic003G180900--Sobic006G032500 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic008G084700--Sobic009G104201 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic008G084700--Sobic003G372700 Sobic008G084700--Sobic005G118600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G084700--Sobic004G007100 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic008G084700--Sobic009G086900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic008G084700--Sobic002G180666 Sobic008G084700--Sobic006G032500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic008G084700--Sobic002G243900 Sobic003G225700 Sobic003G225700 Sobic008G084700--Sobic003G225700 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic006G116100--Sobic008G153000 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic006G116100--Sobic008G149800 Sobic008G173100 Sobic008G173100 Sobic006G116100--Sobic008G173100 Sobic003G160000 Sobic003G160000 Sobic006G116100--Sobic003G160000 Sobic002G063900 Sobic002G063900 Sobic006G116100--Sobic002G063900 Sobic002G357700 Sobic002G357700 Sobic006G116100--Sobic002G357700 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic006G116100--Sobic003G241200 Sobic006G116100--Sobic009G119000 Sobic003G416700 Sobic003G416700 Sobic006G116100--Sobic003G416700 Sobic005G118600--Sobic003G059750 Sobic005G118600--Sobic008G084700 Sobic005G118600--Sobic003G225700 Sobic001G065000 Sobic001G065000 Sobic005G118600--Sobic001G065000 Sobic009G166300 Sobic009G166300 Sobic005G118600--Sobic009G166300 Sobic005G118600--Sobic008G153000 Sobic001G114000 Sobic001G114000 Sobic005G118600--Sobic001G114000 Sobic002G071500 Sobic002G071500 Sobic005G118600--Sobic002G071500 Sobic007G103600 Sobic007G103600 Sobic005G118600--Sobic007G103600 Sobic003G444800--SobicK028600 Sobic003G444800--Sobic003G059750 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic003G444800--Sobic002G103600 Sobic004G357100 Sobic004G357100 Sobic003G444800--Sobic004G357100 Sobic007G042400 Sobic007G042400 Sobic003G444800--Sobic007G042400 Sobic002G112700 Sobic002G112700 Sobic003G444800--Sobic002G112700 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic003G444800--Sobic010G279450 Sobic006G234700 Sobic006G234700 Sobic003G444800--Sobic006G234700 Sobic001G376200 Sobic001G376200 Sobic003G444800--Sobic001G376200 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic009G119000--Sobic002G153700 Sobic009G119000--Sobic003G059750 Sobic009G119000--Sobic002G071500 Sobic010G065300 Sobic010G065300 Sobic009G119000--Sobic010G065300 Sobic009G119000--Sobic008G153000 Sobic010G275500 Sobic010G275500 Sobic009G119000--Sobic010G275500 Sobic009G119000--Sobic003G416700 Sobic004G048800 Sobic004G048800 Sobic009G119000--Sobic004G048800 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic009G119000--Sobic001G311500 Sobic003G059750--Sobic007G103600 Sobic005G207500 Sobic005G207500 Sobic003G059750--Sobic005G207500 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G059750--Sobic005G112300 Sobic003G059750--Sobic010G279450 Sobic002G404700 Sobic002G404700 Sobic003G059750--Sobic002G404700 Sobic003G059750--Sobic003G444800 Sobic003G059750--Sobic001G311500 Sobic002G405800 Sobic002G405800 Sobic003G059750--Sobic002G405800 Sobic003G059750--Sobic002G071500 SobicK028600--Sobic003G444800 SobicK028600--Sobic004G357100 Sobic001G308400 Sobic001G308400 SobicK028600--Sobic001G308400 SobicK028600--Sobic002G103600 SobicK028600--Sobic007G042400 SobicK028600--Sobic006G116100 Sobic003G043000 Sobic003G043000 SobicK028600--Sobic003G043000 SobicK028600--Sobic006G234700 SobicK028600--Sobic002G063900 Sobic010G116600 Sobic010G116600 Sobic002G299700--Sobic010G116600 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic002G299700--Sobic001G363500 Sobic002G299700--Sobic005G112300 Sobic002G397500 Sobic002G397500 Sobic002G299700--Sobic002G397500 Sobic002G299700--Sobic004G048800 Sobic004G242400 Sobic004G242400 Sobic002G299700--Sobic004G242400 Sobic007G105100 Sobic007G105100 Sobic002G299700--Sobic007G105100 Sobic003G408600 Sobic003G408600 Sobic002G299700--Sobic003G408600 Sobic007G062800 Sobic007G062800 Sobic002G299700--Sobic007G062800 Sobic006G032500--Sobic002G180666 Sobic006G032500--Sobic003G372700 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic006G032500--Sobic003G148000 Sobic006G032500--Sobic003G059750 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G032500--Sobic002G145101 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic006G032500--Sobic007G161300 Sobic006G032500--Sobic005G112300 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic006G032500--Sobic010G139000 Sobic006G032500--Sobic008G084700
Octagon: transcription factors


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