Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G151500.1,Sobic.006G151500.2
Synonym ATCKX6, CKX6, Sb06g022930, ATCKX7
Functional annotation cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RE23 , C5YCF7
Pfam PF01565 PF09265
Panther DB PTHR13878 PTHR13878:SF59
NCBI CDD KOG1231; Proteins containing the FAD binding domain
KEGG Orthology K00279; cytokinin dehydrogenase
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity GO:0009690cytokinin metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G41510 : cytokinin oxidase/dehydrogenase 6,cytokinin oxidase/dehydrogenase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g44230.1 : cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010627 , Zm00025a056534
Brachypodium PNT61513 , PNT61512 , KQJ83658
Barley HORVU2Hr1G090160.5 , HORVU2Hr1G090150.3 , HORVU3Hr1G027430.3 , HORVU3Hr1G027430.2 , HORVU3Hr1G027430.1 , HORVU3Hr1G027430.6 , HORVU3Hr1G027430.5 , HORVU3Hr1G027430.4 , HORVU0Hr1G005240.3 , HORVU0Hr1G005240.2 , HORVU0Hr1G005240.1
Wheat TraesCS2D02G374600 , TraesCS2B02G395200 , TraesCS2A02G378300 , TraesCS3D02G143600 , TraesCS3A02G311100 , TraesCS3D02G143200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G173500 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
2 Sobic.005G069000 OsWAK124 - OsWAK receptor-like protein OsWAK-RLP, expressed -
3 Sobic.005G202800 - -
4 Sobic.010G187500 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G075566 - -
6 Sobic.008G008801 - -
7 Sobic.001G327900 SHR, putative, expressed -
8 Sobic.003G023600 peptide-N4-asparagine amidase A, putative, expressed -
9 Sobic.005G110541 - K16054: methylthioribulose 1-phosphate dehydratase / enolase-phosphatase E1
10 Sobic.004G002901 - K02940: RP-L9e, large subunit ribosomal protein L9e
11 Sobic.005G105700 beta,beta-carotene 9,10-dioxygenase, putative, expressed K17913: carlactone synthase / all-trans-10'-apo-beta-carotenal 13,14-cleaving dioxygenase
12 Sobic.005G162400 GATA transcription factor 25, putative, expressed -
13 Sobic.003G270400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G177100 glycosyl hydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.007G177400 OsFBX306 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G245400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
17 Sobic.010G179900 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G220300 OsWAK123 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
19 Sobic.002G030650 - -
20 Sobic.001G388000 GTPase-activating protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G151500 Sobic006G151500 Sobic002G173500 Sobic002G173500 Sobic006G151500--Sobic002G173500 Sobic005G069000 Sobic005G069000 Sobic006G151500--Sobic005G069000 Sobic005G202800 Sobic005G202800 Sobic006G151500--Sobic005G202800 Sobic010G187500 Sobic010G187500 Sobic006G151500--Sobic010G187500 Sobic003G075566 Sobic003G075566 Sobic006G151500--Sobic003G075566 Sobic008G008801 Sobic008G008801 Sobic006G151500--Sobic008G008801 Sobic001G327900 Sobic001G327900 Sobic006G151500--Sobic001G327900 Sobic003G023600 Sobic003G023600 Sobic006G151500--Sobic003G023600 Sobic005G110541 Sobic005G110541 Sobic006G151500--Sobic005G110541 Sobic002G030650 Sobic002G030650 Sobic002G173500--Sobic002G030650 Sobic002G173500--Sobic010G187500 Sobic002G173500--Sobic005G110541 Sobic008G058400 Sobic008G058400 Sobic002G173500--Sobic008G058400 Sobic001G388000 Sobic001G388000 Sobic002G173500--Sobic001G388000 Sobic003G270400 Sobic003G270400 Sobic002G173500--Sobic003G270400 Sobic002G173500--Sobic005G069000 Sobic002G173500--Sobic003G023600 Sobic009G006300 Sobic009G006300 Sobic002G173500--Sobic009G006300 Sobic007G057300 Sobic007G057300 Sobic005G069000--Sobic007G057300 Sobic003G428800 Sobic003G428800 Sobic005G069000--Sobic003G428800 Sobic001G278500 Sobic001G278500 Sobic005G069000--Sobic001G278500 Sobic009G225800 Sobic009G225800 Sobic005G069000--Sobic009G225800 Sobic008G099600 Sobic008G099600 Sobic005G069000--Sobic008G099600 Sobic005G068900 Sobic005G068900 Sobic005G069000--Sobic005G068900 Sobic005G069000--Sobic008G008801 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic005G069000--Sobic007G015100 Sobic008G099300 Sobic008G099300 Sobic005G069000--Sobic008G099300 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic005G202800--Sobic004G002901 Sobic005G105700 Sobic005G105700 Sobic005G202800--Sobic005G105700 Sobic005G202800--Sobic003G023600 Sobic004G228600 Sobic004G228600 Sobic005G202800--Sobic004G228600 Sobic006G015300 Sobic006G015300 Sobic005G202800--Sobic006G015300 Sobic007G177400 Sobic007G177400 Sobic005G202800--Sobic007G177400 Sobic004G346300 Sobic004G346300 Sobic005G202800--Sobic004G346300 Sobic009G095800 Sobic009G095800 Sobic005G202800--Sobic009G095800 Sobic002G025500 Sobic002G025500 Sobic005G202800--Sobic002G025500 Sobic010G187500--Sobic005G110541 Sobic005G100800 Sobic005G100800 Sobic010G187500--Sobic005G100800 Sobic010G187500--Sobic002G030650 Sobic010G093300 Sobic010G093300 Sobic010G187500--Sobic010G093300 Sobic007G193200 Sobic007G193200 Sobic010G187500--Sobic007G193200 Sobic001G353200 Sobic001G353200 Sobic010G187500--Sobic001G353200 Sobic010G187500--Sobic003G023600 Sobic006G224500 Sobic006G224500 Sobic010G187500--Sobic006G224500 Sobic005G194900 Sobic005G194900 Sobic010G187500--Sobic005G194900 Sobic003G075566--Sobic005G202800 Sobic005G162400 Sobic005G162400 Sobic003G075566--Sobic005G162400 Sobic003G075566--Sobic006G015300 Sobic003G075566--Sobic005G105700 Sobic003G419200 Sobic003G419200 Sobic003G075566--Sobic003G419200 Sobic007G042600 Sobic007G042600 Sobic003G075566--Sobic007G042600 Sobic005G220300 Sobic005G220300 Sobic003G075566--Sobic005G220300 Sobic003G075566--Sobic007G177400 Sobic007G064500 Sobic007G064500 Sobic003G075566--Sobic007G064500 Sobic006G121000 Sobic006G121000 Sobic008G008801--Sobic006G121000 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic008G008801--Sobic005G060200 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic008G008801--Sobic007G015000 Sobic007G212000 Sobic007G212000 Sobic008G008801--Sobic007G212000 Sobic002G178101 Sobic002G178101 Sobic008G008801--Sobic002G178101 Sobic002G178200 Sobic002G178200 Sobic008G008801--Sobic002G178200 Sobic005G216400 Sobic005G216400 Sobic008G008801--Sobic005G216400 Sobic003G443700 Sobic003G443700 Sobic008G008801--Sobic003G443700 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic008G008801--Sobic005G097900 Sobic001G327900--Sobic008G099600 Sobic001G327900--Sobic001G278500 Sobic001G327900--Sobic005G069000 Sobic003G428300 Sobic003G428300 Sobic001G327900--Sobic003G428300 Sobic004G323900 Sobic004G323900 Sobic001G327900--Sobic004G323900 Sobic006G114600 Sobic006G114600 Sobic001G327900--Sobic006G114600 Sobic008G079800 Sobic008G079800 Sobic001G327900--Sobic008G079800 Sobic001G327900--Sobic010G187500 Sobic001G327900--Sobic003G428800 Sobic003G023600--Sobic004G346300 Sobic003G023600--Sobic007G212000 Sobic003G023600--Sobic007G177400 Sobic003G023600--Sobic004G002901 Sobic001G181600 Sobic001G181600 Sobic003G023600--Sobic001G181600 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic003G023600--Sobic007G111800 Sobic003G154500 Sobic003G154500 Sobic003G023600--Sobic003G154500 Sobic003G357700 Sobic003G357700 Sobic003G023600--Sobic003G357700 Sobic003G023600--Sobic005G105700 Sobic005G110541--Sobic005G100800 Sobic005G110541--Sobic007G193200 Sobic005G110541--Sobic001G353200 Sobic005G110541--Sobic010G187500 Sobic004G261500 Sobic004G261500 Sobic005G110541--Sobic004G261500 Sobic001G443100 Sobic001G443100 Sobic005G110541--Sobic001G443100 Sobic005G110541--Sobic007G212000 Sobic001G243100 Sobic001G243100 Sobic005G110541--Sobic001G243100 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic005G110541--Sobic004G299500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.