Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G168200.1
Synonym ethylene response factor 68, Sb06g024390, SbERF68, ERF5, ATERF5, ATERF-5
Functional annotation Not investigated (PubMedID : 23766026)
AP2 domain containing protein, expressed
UniProt C5YDF0
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31190 PTHR31190:SF29
NCBI CDD -
KEGG Orthology K09286; EREBP-like factor
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G47230 : ethylene responsive element binding factor 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g46250.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035951 , Zm00025a010335 , Zm00025a010338 , Zm00025a022855 , Zm00025a033320
Brachypodium KQK09018 , KQK19497 , KQJ83907 , KQJ95603
Barley HORVU3Hr1G030310.1 , HORVU6Hr1G062430.1 , HORVU1Hr1G055710.1 , HORVU1Hr1G055710.3
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G042900 expressed protein -
2 Sobic.005G054150 - -
3 Sobic.009G189700 - -
4 Sobic.006G272400 tentative name(PubMedID : 31536532)@core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed -
5 Sobic.010G274100 spotted leaf 11, putative, expressed -
6 Sobic.004G008200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
7 Sobic.002G170100 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed K01784: galE, UDP-glucose 4-epimerase
8 Sobic.005G049200 exo70 exocyst complex subunit, putative, expressed -
9 Sobic.005G144000 glycosyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.009G242200 CGMC_MAPKCMGC_2.3 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
11 Sobic.008G057800 methyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.005G092100 - -
13 Sobic.004G158100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
14 Sobic.003G013900 - -
15 Sobic.003G191350 - -
16 Sobic.001G024700 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G286000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G110932 - -
19 Sobic.005G120400 CBS domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G202900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G168200 Sobic006G168200 Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic006G168200--Sobic005G042900 Sobic005G054150 Sobic005G054150 Sobic006G168200--Sobic005G054150 Sobic009G189700 Sobic009G189700 Sobic006G168200--Sobic009G189700 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic006G168200--Sobic006G272400 Sobic010G274100 Sobic010G274100 Sobic006G168200--Sobic010G274100 Sobic004G008200 Sobic004G008200 Sobic006G168200--Sobic004G008200 Sobic002G170100 Sobic002G170100 Sobic006G168200--Sobic002G170100 Sobic005G049200 Sobic005G049200 Sobic006G168200--Sobic005G049200 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic006G168200--Sobic005G144000 Sobic005G042900--Sobic006G272400 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic005G042900--Sobic001G202900 Sobic003G286000 Sobic003G286000 Sobic005G042900--Sobic003G286000 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic005G042900--Sobic009G165900 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G042900--Sobic004G158100 Sobic001G024700 Sobic001G024700 Sobic005G042900--Sobic001G024700 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic005G042900--Sobic001G364700 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic005G042900--Sobic001G222800 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic005G042900--Sobic008G075800 Sobic005G054150--Sobic002G170100 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic005G054150--Sobic009G242200 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic005G054150--Sobic007G091400 Sobic005G054150--Sobic010G274100 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic005G054150--Sobic004G358000 Sobic006G095700 Sobic006G095700 Sobic005G054150--Sobic006G095700 Sobic003G042800 Sobic003G042800 Sobic005G054150--Sobic003G042800 Sobic001G254000 Sobic001G254000 Sobic005G054150--Sobic001G254000 Sobic003G013900 Sobic003G013900 Sobic005G054150--Sobic003G013900 Sobic009G189700--Sobic005G144000 Sobic009G189700--Sobic002G170100 Sobic001G503600 Sobic001G503600 Sobic009G189700--Sobic001G503600 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic009G189700--Sobic008G071300 Sobic009G189700--Sobic006G272400 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic009G189700--Sobic001G039100 Sobic009G189700--Sobic009G242200 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic009G189700--Sobic003G441000 Sobic009G189700--Sobic005G042900 Sobic006G272400--Sobic001G202900 Sobic006G272400--Sobic009G165900 Sobic006G272400--Sobic004G158100 Sobic006G272400--Sobic001G222800 Sobic006G272400--Sobic008G075800 Sobic006G272400--Sobic003G286000 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic006G272400--Sobic004G336401 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic006G272400--Sobic008G097800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic006G272400--Sobic002G145400 Sobic010G274100--Sobic004G158100 Sobic008G057800 Sobic008G057800 Sobic010G274100--Sobic008G057800 Sobic010G274100--Sobic001G024700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic010G274100--Sobic001G539820 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic010G274100--Sobic005G009700 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic010G274100--Sobic002G128700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic010G274100--Sobic002G225800 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic010G274100--Sobic003G195400 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic010G274100--Sobic005G065300 Sobic004G008200--Sobic010G274100 Sobic004G134900 Sobic004G134900 Sobic004G008200--Sobic004G134900 Sobic004G008200--Sobic008G057800 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic004G008200--Sobic005G035250 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic004G008200--Sobic008G011901 Sobic004G008200--Sobic002G145400 Sobic004G008200--Sobic008G097800 Sobic004G008200--Sobic003G195400 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic004G008200--Sobic005G035200 Sobic002G170100--Sobic009G242200 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic002G170100--Sobic002G380300 Sobic005G170400 Sobic005G170400 Sobic002G170100--Sobic005G170400 Sobic002G170100--Sobic004G358000 Sobic003G218100 Sobic003G218100 Sobic002G170100--Sobic003G218100 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic002G170100--Sobic003G290500 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic002G170100--Sobic003G304600 Sobic002G170100--Sobic005G144000 Sobic002G283200 Sobic002G283200 Sobic002G170100--Sobic002G283200 Sobic005G049200--Sobic009G165900 Sobic005G049200--Sobic004G158100 Sobic005G049200--Sobic003G013900 Sobic005G049200--Sobic010G274100 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic005G049200--Sobic002G395100 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic005G049200--Sobic010G034200 Sobic009G089000 Sobic009G089000 Sobic005G049200--Sobic009G089000 Sobic005G044600 Sobic005G044600 Sobic005G049200--Sobic005G044600 Sobic008G048200 Sobic008G048200 Sobic005G049200--Sobic008G048200 Sobic005G144000--Sobic003G441000 Sobic005G144000--Sobic002G170100 Sobic008G122800 Sobic008G122800 Sobic005G144000--Sobic008G122800 Sobic001G279000 Sobic001G279000 Sobic005G144000--Sobic001G279000 Sobic005G144000--Sobic009G242200 Sobic005G144000--Sobic001G503600 Sobic004G180100 Sobic004G180100 Sobic005G144000--Sobic004G180100 Sobic005G144000--Sobic008G071300 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic005G144000--Sobic002G404600
Octagon: transcription factors


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