Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G253100.2,Sobic.006G253100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C6JS88 , A0A1B6PNU4
Pfam PF13365
Panther DB PTHR36141 PTHR36141:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g05310.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G321500 expressed protein -
2 Sobic.003G443800 expressed protein -
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6 Sobic.001G209600 DUF domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G195400 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G096400 expressed protein -
9 Sobic.006G163200 COBRA, putative, expressed -
10 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase
12 Sobic.010G039600 - -
13 Sobic.006G189500 OsMADS17 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
14 Sobic.008G161201 - K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
15 Sobic.002G076600 rc - bHLH transcription factor regulating proanthocyanidin production in seeds, expressed -
16 Sobic.005G070800 - -
17 Sobic.001G345700 zinc-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G152400 - -
19 Sobic.004G029601 - -
20 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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