Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G008400.1
Synonym Sb07g000890, TED6
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PET1
Pfam -
Panther DB PTHR35697 PTHR35697:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G43790 : tracheary element differentiation-related 6
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT65644
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G166900 transferase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G147400 dirigent, putative, expressed -
3 Sobic.009G253300 Myb family transcription factor(PubMedID : 26320239)@Myb transcription factor, putative, expressed -
4 Sobic.004G296100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
5 Sobic.005G145100 phospholipase A2, putative, expressed -
6 Sobic.008G037200 expressed protein -
7 Sobic.002G028500 app1, putative, expressed -
8 Sobic.001G170900 expressed protein -
9 Sobic.001G208600 receptor kinase like protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G006100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.004G049800 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.008G084200 fasciclin domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G290300 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.006G238000 LTPL128 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.005G061700 dirigent, putative, expressed -
16 Sobic.002G020000 wax synthase, putative, expressed -
17 Sobic.003G239100 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G234101 - -
19 Sobic.001G334900 X8 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G053900 Cupin domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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