Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G083100.1,Sobic.007G083100.6,Sobic.007G083100.4,Sobic.007G083100.5,Sobic.007G083100.7
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PGD7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G100100 - -
2 Sobic.007G112700 - -
3 Sobic.008G056900 RFC4 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 4, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
4 Sobic.002G380100 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
5 Sobic.009G096100 endoribonuclease Dicer, putative, expressed -
6 Sobic.001G261537 - -
7 Sobic.002G344500 pentatricopeptide, putative, expressed K18213: proteinaceous RNase P
8 Sobic.001G061600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peptidase M50, mammalian sterol-regulatory element binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G175600 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G074300 glutathione S-transferase, putative, expressed K01800: maiA, maleylacetoacetate isomerase
11 Sobic.008G017100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
12 Sobic.007G043900 Brix domain containing protein, putative, expressed K14561: U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4
13 Sobic.006G131200 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, putative, expressed K03018: RPC1, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
14 Sobic.008G125100 Mur ligase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.008G081600 expressed protein -
16 Sobic.010G157700 expressed protein -
17 Sobic.008G068400 - -
18 Sobic.002G141900 -(PubMedID : 26976818)@Citrate transporter protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G236800 tRNA methyltransferase, putative, expressed K00927: PGK, phosphoglycerate kinase
20 Sobic.003G163100 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13


Gene co-expression network
sample Sobic007G083100 Sobic007G083100 Sobic007G100100 Sobic007G100100 Sobic007G083100--Sobic007G100100 Sobic007G112700 Sobic007G112700 Sobic007G083100--Sobic007G112700 Sobic008G056900 Sobic008G056900 Sobic007G083100--Sobic008G056900 Sobic002G380100 Sobic002G380100 Sobic007G083100--Sobic002G380100 Sobic009G096100 Sobic009G096100 Sobic007G083100--Sobic009G096100 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic007G083100--Sobic001G261537 Sobic002G344500 Sobic002G344500 Sobic007G083100--Sobic002G344500 Sobic001G061600 Sobic001G061600 Sobic007G083100--Sobic001G061600 Sobic004G175600 Sobic004G175600 Sobic007G083100--Sobic004G175600 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic007G100100--Sobic010G139301 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic007G100100--Sobic007G089600 Sobic002G182150 Sobic002G182150 Sobic007G100100--Sobic002G182150 Sobic002G107532 Sobic002G107532 Sobic007G100100--Sobic002G107532 Sobic007G100100--Sobic007G083100 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic007G100100--Sobic007G112900 Sobic006G072900 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Octagon: transcription factors


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