Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G056900.3,Sobic.008G056900.1
Synonym RFC4, Sb08g004780, EMB1968
Functional annotation RFC4 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 4, expressed
UniProt C5YST1
Pfam PF00004 PF08542
Panther DB PTHR11669 PTHR11669:SF17
NCBI CDD KOG0989; Replication factor C, subunit RFC4
KEGG Orthology K10755; replication factor C subunit 2/4
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G21690 : ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07720.1 : RFC4 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 4, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054061
Brachypodium KQJ92020 , PNT65360
Barley HORVU5Hr1G037020.15 , HORVU5Hr1G037020.14 , HORVU5Hr1G037020.13 , HORVU5Hr1G037020.12 , HORVU5Hr1G037020.11 , HORVU5Hr1G037020.10 , HORVU5Hr1G037020.7 , HORVU5Hr1G037020.4 , HORVU5Hr1G037020.3 , HORVU5Hr1G037020.1 , HORVU5Hr1G037020.6 , HORVU5Hr1G037020.5 , HORVU5Hr1G037020.2 , HORVU5Hr1G037020.9 , HORVU5Hr1G037020.8
Wheat TraesCS5B02G119700 , TraesCS5A02G113700 , TraesCS5D02G128600 , TraesCS5D02G128600
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cDNA sequences
Sobic.008G056900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic008G056900 Sobic008G056900 Sobic009G096100 Sobic009G096100 Sobic008G056900--Sobic009G096100 Sobic001G485600 Sobic001G485600 Sobic008G056900--Sobic001G485600 Sobic008G081600 Sobic008G081600 Sobic008G056900--Sobic008G081600 Sobic007G000400 Sobic007G000400 Sobic008G056900--Sobic007G000400 Sobic002G344500 Sobic002G344500 Sobic008G056900--Sobic002G344500 Sobic007G197400 Sobic007G197400 Sobic008G056900--Sobic007G197400 Sobic004G227100 Sobic004G227100 Sobic008G056900--Sobic004G227100 Sobic007G077700 Sobic007G077700 Sobic008G056900--Sobic007G077700 Sobic001G087100 Sobic001G087100 Sobic008G056900--Sobic001G087100 Sobic009G096100--Sobic008G056900 Sobic002G192500 Sobic002G192500 Sobic009G096100--Sobic002G192500 Sobic010G157700 Sobic010G157700 Sobic009G096100--Sobic010G157700 Sobic009G096100--Sobic001G485600 Sobic006G056000 Sobic006G056000 Sobic009G096100--Sobic006G056000 Sobic007G043900 Sobic007G043900 Sobic009G096100--Sobic007G043900 Sobic009G096100--Sobic002G344500 Sobic002G380100 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Octagon: transcription factors


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