Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G090448.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9R9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G21640 : FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05090.1 : peptidyl-prolyl isomerase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013033
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G073001 - -
2 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -
3 Sobic.010G267650 - -
4 Sobic.002G224450 - -
5 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
6 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G022100 expressed protein -
8 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.010G101700 - -
12 Sobic.005G221425 - -
13 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
14 Sobic.008G025900 expressed protein -
15 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
16 Sobic.007G037301 - -
17 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
18 Sobic.008G049701 - -
19 Sobic.005G117801 - -
20 Sobic.009G157500 MYB family transcription factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G090448 Sobic007G090448 Sobic006G073001 Sobic006G073001 Sobic007G090448--Sobic006G073001 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic007G090448--Sobic008G026100 Sobic010G267650 Sobic010G267650 Sobic007G090448--Sobic010G267650 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic007G090448--Sobic002G224450 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic007G090448--Sobic004G121000 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic007G090448--Sobic005G139800 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic007G090448--Sobic001G022100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic007G090448--Sobic001G240400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic007G090448--Sobic009G209800 Sobic006G073001--Sobic007G090448 Sobic005G003900 Sobic005G003900 Sobic006G073001--Sobic005G003900 Sobic006G122900 Sobic006G122900 Sobic006G073001--Sobic006G122900 Sobic002G166500 Sobic002G166500 Sobic006G073001--Sobic002G166500 Sobic002G106100 Sobic002G106100 Sobic006G073001--Sobic002G106100 Sobic006G210100 Sobic006G210100 Sobic006G073001--Sobic006G210100 Sobic006G073001--Sobic010G267650 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic006G073001--Sobic009G251300 Sobic004G123600 Sobic004G123600 Sobic006G073001--Sobic004G123600 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic008G026100--Sobic005G110427 Sobic008G026100--Sobic009G209800 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic008G026100--Sobic006G262200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G026100--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic005G139800 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic008G026100--Sobic004G092300 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic001G287301 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic008G026100--Sobic006G114000 Sobic010G267650--Sobic005G003900 Sobic003G128500 Sobic003G128500 Sobic010G267650--Sobic003G128500 Sobic001G262500 Sobic001G262500 Sobic010G267650--Sobic001G262500 Sobic006G111500 Sobic006G111500 Sobic010G267650--Sobic006G111500 Sobic010G267650--Sobic007G090448 Sobic009G230400 Sobic009G230400 Sobic010G267650--Sobic009G230400 Sobic010G267650--Sobic006G073001 Sobic004G310700 Sobic004G310700 Sobic010G267650--Sobic004G310700 Sobic007G159800 Sobic007G159800 Sobic010G267650--Sobic007G159800 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic004G121000 Sobic002G224450--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic005G221425 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G224450--Sobic001G287101 Sobic002G224450--Sobic005G139800 Sobic002G224450--Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic005G110427 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic002G224450--Sobic003G436900 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic001G022100--Sobic008G025900 Sobic009G137800 Sobic009G137800 Sobic001G022100--Sobic009G137800 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic001G022100--Sobic005G096800 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic001G022100--Sobic002G400900 Sobic001G022100--Sobic005G139800 Sobic001G022100--Sobic005G221425 Sobic001G022100--Sobic002G224450 Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic001G022100--Sobic002G166600 Sobic003G185200 Sobic003G185200 Sobic001G022100--Sobic003G185200 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic002G410200
Octagon: transcription factors


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