Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G073001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDL2
Pfam -
Panther DB PTHR35552 PTHR35552:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G03070 : mediator subunit 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g31010.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047894
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G090448 - -
2 Sobic.005G003900 phosphatidate cytidylyltransferase, putative, expressed K15892: farnesol kinase
3 Sobic.006G122900 expressed protein K15360: STRA13, CENPX, centromere protein X
4 Sobic.002G166500 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17500: integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C
5 Sobic.002G106100 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G210100 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
7 Sobic.010G267650 - -
8 Sobic.009G251300 endonuclease, putative, expressed -
9 Sobic.004G123600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@PPR repeat domain containing protein, putative, expressed K18213: proteinaceous RNase P
10 Sobic.001G022100 expressed protein -
11 Sobic.001G285800 expressed protein -
12 Sobic.003G163100 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
13 Sobic.001G375300 ulp1 protease family protein, putative, expressed K08592: sentrin-specific protease 1
14 Sobic.008G153600 WRKY94, expressed -
15 Sobic.005G077933 - -
16 Sobic.003G259901 - -
17 Sobic.007G159800 DNA binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G124200 expressed protein -
19 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
20 Sobic.004G326400 ankyrin repeat-rich protein, putative, expressed K19044: E3 ubiquitin-protein ligase XBAT32/33


Gene co-expression network
sample Sobic006G073001 Sobic006G073001 Sobic007G090448 Sobic007G090448 Sobic006G073001--Sobic007G090448 Sobic005G003900 Sobic005G003900 Sobic006G073001--Sobic005G003900 Sobic006G122900 Sobic006G122900 Sobic006G073001--Sobic006G122900 Sobic002G166500 Sobic002G166500 Sobic006G073001--Sobic002G166500 Sobic002G106100 Sobic002G106100 Sobic006G073001--Sobic002G106100 Sobic006G210100 Sobic006G210100 Sobic006G073001--Sobic006G210100 Sobic010G267650 Sobic010G267650 Sobic006G073001--Sobic010G267650 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic006G073001--Sobic009G251300 Sobic004G123600 Sobic004G123600 Sobic006G073001--Sobic004G123600 Sobic007G090448--Sobic006G073001 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic007G090448--Sobic008G026100 Sobic007G090448--Sobic010G267650 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic007G090448--Sobic002G224450 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic007G090448--Sobic004G121000 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic007G090448--Sobic005G139800 Sobic001G022100 Sobic001G022100 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Sobic004G132400 Sobic004G132400 Sobic004G123600--Sobic004G132400
Octagon: transcription factors


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