Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G326400.1
Synonym Sb04g035590, XBAT32
Functional annotation ankyrin repeat-rich protein, putative, expressed
UniProt C5XUC8
Pfam PF13857 PF12796
Panther DB PTHR24128 PTHR24128:SF22
NCBI CDD KOG4412; 26S proteasome regulatory complex, subunit PSMD10
KEGG Orthology K19044; E3 ubiquitin-protein ligase XBAT32/33
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G57740 : XB3 ortholog 2 in Arabidopsis thaliana
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g54860.2 : ankyrin repeat-rich protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032965
Brachypodium KQK01093 , PNT69326
Barley -
Wheat TraesCS6D02G335000 , TraesCS6D02G335000 , TraesCS6A02G352300 , TraesCS6B02G385200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G326400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G401000 adaptin, putative, expressed K12400: AP-4 complex subunit epsilon-1
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20 Sobic.007G205800 chaperone protein dnaJ 10, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G326400 Sobic004G326400 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic004G326400--Sobic003G401000 Sobic002G090800 Sobic002G090800 Sobic004G326400--Sobic002G090800 Sobic008G136200 Sobic008G136200 Sobic004G326400--Sobic008G136200 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic004G326400--Sobic001G407200 Sobic008G041700 Sobic008G041700 Sobic004G326400--Sobic008G041700 Sobic004G345700 Sobic004G345700 Sobic004G326400--Sobic004G345700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic004G326400--Sobic001G094000 Sobic004G057400 Sobic004G057400 Sobic004G326400--Sobic004G057400 Sobic009G257800 Sobic009G257800 Sobic004G326400--Sobic009G257800 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic003G401000--Sobic002G158700 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic003G401000--Sobic003G187400 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic003G401000--Sobic002G157300 Sobic003G401000--Sobic009G257800 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic003G401000--Sobic001G155000 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic003G401000--Sobic009G040700 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Octagon: transcription factors


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