Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G122900.1
Synonym Sb06g020330
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YAT3
Pfam PF09415
Panther DB PTHR28680
NCBI CDD -
KEGG Orthology K15360; STRA13, CENPX, centromere protein X
Gene Ontology GO:0006281; DNA repair


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78790 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g40550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056312 , Zm00025a010973
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G122900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.001G199900 expressed protein -
15 Sobic.002G098701 - -
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19 Sobic.004G134500 expressed protein -
20 Sobic.010G267650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G122900 Sobic006G122900 Sobic003G396300 Sobic003G396300 Sobic006G122900--Sobic003G396300 Sobic006G073001 Sobic006G073001 Sobic006G122900--Sobic006G073001 Sobic008G081150 Sobic008G081150 Sobic006G122900--Sobic008G081150 Sobic003G037900 Sobic003G037900 Sobic006G122900--Sobic003G037900 Sobic004G123600 Sobic004G123600 Sobic006G122900--Sobic004G123600 Sobic004G307700 Sobic004G307700 Sobic006G122900--Sobic004G307700 Sobic006G266600 Sobic006G266600 Sobic006G122900--Sobic006G266600 Sobic003G284500 Sobic003G284500 Sobic006G122900--Sobic003G284500 Sobic002G166500 Sobic002G166500 Sobic006G122900--Sobic002G166500 Sobic003G396300--Sobic008G081150 Sobic003G396300--Sobic006G122900 Sobic004G359200 Sobic004G359200 Sobic003G396300--Sobic004G359200 Sobic010G098400 Sobic010G098400 Sobic003G396300--Sobic010G098400 Sobic004G123300 Sobic004G123300 Sobic003G396300--Sobic004G123300 Sobic001G345000 Sobic001G345000 Sobic003G396300--Sobic001G345000 Sobic001G381900 Sobic001G381900 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Octagon: transcription factors


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