Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G210101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNG5
Pfam PF12874
Panther DB PTHR21213
NCBI CDD KOG4118; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39580.1 : ZOS2-12 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G055830.1
Wheat TraesCS6B02G248000 , TraesCS6A02G218400 , TraesCS6D02G201600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G075900 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
2 Sobic.001G157500 expressed protein -
3 Sobic.001G032900 expressed protein -
4 Sobic.003G284500 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22, putative, expressed K15139: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
5 Sobic.001G513100 LYR motif containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G411300 expressed protein -
7 Sobic.003G074000 expressed protein K12593: MPHOSPH6, M-phase phosphoprotein 6, animal type
8 Sobic.009G225900 60S ribosomal protein L35a-3, putative, expressed K02917: RP-L35Ae, large subunit ribosomal protein L35Ae
9 Sobic.006G122900 expressed protein K15360: STRA13, CENPX, centromere protein X
10 Sobic.001G171500 presenilin, putative, expressed K04505: PSEN1, presenilin 1
11 Sobic.003G128500 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G219800 expressed protein -
13 Sobic.008G109900 expressed protein -
14 Sobic.009G050100 ATKINESIN-13A/KINESIN-13A, putative, expressed K11091: U1 small nuclear ribonucleoprotein A
15 Sobic.007G216600 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
16 Sobic.006G177100 expressed protein K03671: thioredoxin 1
17 Sobic.002G366700 expressed protein -
18 Sobic.002G121000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.001G013600 expressed protein -
20 Sobic.006G258400 OsFBX153 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G210101 Sobic004G210101 Sobic008G075900 Sobic008G075900 Sobic004G210101--Sobic008G075900 Sobic001G157500 Sobic001G157500 Sobic004G210101--Sobic001G157500 Sobic001G032900 Sobic001G032900 Sobic004G210101--Sobic001G032900 Sobic003G284500 Sobic003G284500 Sobic004G210101--Sobic003G284500 Sobic001G513100 Sobic001G513100 Sobic004G210101--Sobic001G513100 Sobic002G411300 Sobic002G411300 Sobic004G210101--Sobic002G411300 Sobic003G074000 Sobic003G074000 Sobic004G210101--Sobic003G074000 Sobic009G225900 Sobic009G225900 Sobic004G210101--Sobic009G225900 Sobic006G122900 Sobic006G122900 Sobic004G210101--Sobic006G122900 Sobic002G272800 Sobic002G272800 Sobic008G075900--Sobic002G272800 Sobic008G075900--Sobic002G411300 Sobic002G166500 Sobic002G166500 Sobic008G075900--Sobic002G166500 Sobic008G075900--Sobic004G210101 Sobic003G037900 Sobic003G037900 Sobic008G075900--Sobic003G037900 Sobic002G200100 Sobic002G200100 Sobic008G075900--Sobic002G200100 Sobic001G119300 Sobic001G119300 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Octagon: transcription factors


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