Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G032900.1
Synonym Sb01g003080
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WUZ8
Pfam -
Panther DB PTHR33142 PTHR33142:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G02220 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g60760.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016420
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.001G032900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G210101 - -
2 Sobic.003G128500 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G230400 cytokinin-N-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
4 Sobic.006G169400 expressed protein -
5 Sobic.010G087200 expressed protein -
6 Sobic.001G531900 cyclin-like F-box, putative, expressed -
7 Sobic.007G156101 - -
8 Sobic.001G061500 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10573: UBE2A, UBC2, ubiquitin-conjugating enzyme E2 A
9 Sobic.004G310700 glutaredoxin 2, putative, expressed -
10 Sobic.010G267650 - -
11 Sobic.001G428700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G494150 - -
13 Sobic.006G177100 expressed protein K03671: thioredoxin 1
14 Sobic.003G267900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G339400 expressed protein -
16 Sobic.003G293700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.003G284500 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22, putative, expressed K15139: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
18 Sobic.010G027800 Brix domain containing protein, putative, expressed K14846: ribosome production factor 1
19 Sobic.010G266900 expressed protein -
20 Sobic.008G075900 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1


Gene co-expression network
sample Sobic001G032900 Sobic001G032900 Sobic004G210101 Sobic004G210101 Sobic001G032900--Sobic004G210101 Sobic003G128500 Sobic003G128500 Sobic001G032900--Sobic003G128500 Sobic009G230400 Sobic009G230400 Sobic001G032900--Sobic009G230400 Sobic006G169400 Sobic006G169400 Sobic001G032900--Sobic006G169400 Sobic010G087200 Sobic010G087200 Sobic001G032900--Sobic010G087200 Sobic001G531900 Sobic001G531900 Sobic001G032900--Sobic001G531900 Sobic007G156101 Sobic007G156101 Sobic001G032900--Sobic007G156101 Sobic001G061500 Sobic001G061500 Sobic001G032900--Sobic001G061500 Sobic004G310700 Sobic004G310700 Sobic001G032900--Sobic004G310700 Sobic008G075900 Sobic008G075900 Sobic004G210101--Sobic008G075900 Sobic001G157500 Sobic001G157500 Sobic004G210101--Sobic001G157500 Sobic004G210101--Sobic001G032900 Sobic003G284500 Sobic003G284500 Sobic004G210101--Sobic003G284500 Sobic001G513100 Sobic001G513100 Sobic004G210101--Sobic001G513100 Sobic002G411300 Sobic002G411300 Sobic004G210101--Sobic002G411300 Sobic003G074000 Sobic003G074000 Sobic004G210101--Sobic003G074000 Sobic009G225900 Sobic009G225900 Sobic004G210101--Sobic009G225900 Sobic006G122900 Sobic006G122900 Sobic004G210101--Sobic006G122900 Sobic003G128500--Sobic003G284500 Sobic010G267650 Sobic010G267650 Sobic003G128500--Sobic010G267650 Sobic003G359200 Sobic003G359200 Sobic003G128500--Sobic003G359200 Sobic010G097400 Sobic010G097400 Sobic003G128500--Sobic010G097400 Sobic009G050100 Sobic009G050100 Sobic003G128500--Sobic009G050100 Sobic010G040200 Sobic010G040200 Sobic003G128500--Sobic010G040200 Sobic003G377200 Sobic003G377200 Sobic003G128500--Sobic003G377200 Sobic003G148500 Sobic003G148500 Sobic003G128500--Sobic003G148500 Sobic009G235300 Sobic009G235300 Sobic003G128500--Sobic009G235300 Sobic007G159800 Sobic007G159800 Sobic009G230400--Sobic007G159800 Sobic005G003900 Sobic005G003900 Sobic009G230400--Sobic005G003900 Sobic001G056300 Sobic001G056300 Sobic009G230400--Sobic001G056300 Sobic009G230400--Sobic010G267650 Sobic003G296600 Sobic003G296600 Sobic009G230400--Sobic003G296600 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic009G230400--Sobic002G253500 Sobic007G156500 Sobic007G156500 Sobic009G230400--Sobic007G156500 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic009G230400--Sobic002G376800 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic009G230400--Sobic002G108800 Sobic003G397000 Sobic003G397000 Sobic006G169400--Sobic003G397000 Sobic006G169400--Sobic004G310700 Sobic002G320200 Sobic002G320200 Sobic006G169400--Sobic002G320200 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic006G169400--Sobic003G081400 Sobic008G031600 Sobic008G031600 Sobic006G169400--Sobic008G031600 Sobic001G402701 Sobic001G402701 Sobic006G169400--Sobic001G402701 Sobic001G460700 Sobic001G460700 Sobic006G169400--Sobic001G460700 Sobic006G169400--Sobic001G531900 Sobic003G201400 Sobic003G201400 Sobic006G169400--Sobic003G201400 Sobic002G001300 Sobic002G001300 Sobic010G087200--Sobic002G001300 Sobic010G259200 Sobic010G259200 Sobic010G087200--Sobic010G259200 Sobic007G206700 Sobic007G206700 Sobic010G087200--Sobic007G206700 Sobic001G428700 Sobic001G428700 Sobic010G087200--Sobic001G428700 Sobic010G014300 Sobic010G014300 Sobic010G087200--Sobic010G014300 Sobic001G494150 Sobic001G494150 Sobic010G087200--Sobic001G494150 Sobic006G166700 Sobic006G166700 Sobic010G087200--Sobic006G166700 Sobic010G119600 Sobic010G119600 Sobic010G087200--Sobic010G119600 Sobic002G366700 Sobic002G366700 Sobic010G087200--Sobic002G366700 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic001G531900--Sobic010G045300 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic001G531900--Sobic006G133650 Sobic005G022600 Sobic005G022600 Sobic001G531900--Sobic005G022600 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic001G531900--Sobic002G188100 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic001G531900--Sobic009G039400 Sobic001G531900--Sobic003G081400 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic001G531900--Sobic006G167200 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic001G531900--Sobic004G069600 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic001G531900--Sobic010G029200 Sobic003G267900 Sobic003G267900 Sobic007G156101--Sobic003G267900 Sobic001G017900 Sobic001G017900 Sobic007G156101--Sobic001G017900 Sobic007G017400 Sobic007G017400 Sobic007G156101--Sobic007G017400 Sobic002G285300 Sobic002G285300 Sobic007G156101--Sobic002G285300 Sobic006G192400 Sobic006G192400 Sobic007G156101--Sobic006G192400 Sobic008G163700 Sobic008G163700 Sobic007G156101--Sobic008G163700 Sobic007G156101--Sobic007G159800 Sobic004G284400 Sobic004G284400 Sobic007G156101--Sobic004G284400 Sobic002G337300 Sobic002G337300 Sobic007G156101--Sobic002G337300 Sobic001G061500--Sobic006G192400 Sobic001G061500--Sobic001G531900 Sobic003G438200 Sobic003G438200 Sobic001G061500--Sobic003G438200 Sobic002G324100 Sobic002G324100 Sobic001G061500--Sobic002G324100 Sobic001G061500--Sobic006G169400 Sobic001G061500--Sobic007G156101 Sobic004G230900 Sobic004G230900 Sobic001G061500--Sobic004G230900 Sobic006G157300 Sobic006G157300 Sobic001G061500--Sobic006G157300 Sobic001G061500--Sobic003G267900 Sobic004G310700--Sobic003G397000 Sobic001G516200 Sobic001G516200 Sobic004G310700--Sobic001G516200 Sobic003G191800 Sobic003G191800 Sobic004G310700--Sobic003G191800 Sobic004G310700--Sobic001G460700 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic004G310700--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic004G310700--Sobic010G152700 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic004G310700--Sobic003G142900 Sobic005G102200 Sobic005G102200 Sobic004G310700--Sobic005G102200 Sobic007G139000 Sobic007G139000 Sobic004G310700--Sobic007G139000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.