Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G013600.1
Synonym Sb01g001340
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WSX8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g11480.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057419
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G255800 - -
2 Sobic.002G366700 expressed protein -
3 Sobic.010G027800 Brix domain containing protein, putative, expressed K14846: ribosome production factor 1
4 Sobic.009G155500 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.006G169400 expressed protein -
6 Sobic.006G258400 OsFBX153 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G402701 - -
8 Sobic.002G339400 expressed protein -
9 Sobic.006G245200 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G109500 - -
11 Sobic.001G494150 - -
12 Sobic.003G127600 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K06688: UBE2C, ubiquitin-conjugating enzyme E2 C
13 Sobic.001G513100 LYR motif containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G180600 expressed protein K18172: COX assembly mitochondrial protein 2
15 Sobic.001G416800 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
16 Sobic.010G097400 thiol-disulphide oxidoreductase DCC, putative, expressed -
17 Sobic.001G531900 cyclin-like F-box, putative, expressed -
18 Sobic.010G087200 expressed protein -
19 Sobic.001G429100 eukaryotic translation initiation factor, putative, expressed K03259: translation initiation factor 4E
20 Sobic.007G028900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G013600 Sobic001G013600 Sobic006G255800 Sobic006G255800 Sobic001G013600--Sobic006G255800 Sobic002G366700 Sobic002G366700 Sobic001G013600--Sobic002G366700 Sobic010G027800 Sobic010G027800 Sobic001G013600--Sobic010G027800 Sobic009G155500 Sobic009G155500 Sobic001G013600--Sobic009G155500 Sobic006G169400 Sobic006G169400 Sobic001G013600--Sobic006G169400 Sobic006G258400 Sobic006G258400 Sobic001G013600--Sobic006G258400 Sobic001G402701 Sobic001G402701 Sobic001G013600--Sobic001G402701 Sobic002G339400 Sobic002G339400 Sobic001G013600--Sobic002G339400 Sobic006G245200 Sobic006G245200 Sobic001G013600--Sobic006G245200 Sobic006G255800--Sobic001G013600 Sobic003G054100 Sobic003G054100 Sobic006G255800--Sobic003G054100 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic006G255800--Sobic004G180600 Sobic002G293900 Sobic002G293900 Sobic006G255800--Sobic002G293900 Sobic006G255800--Sobic010G027800 Sobic006G255800--Sobic006G245200 Sobic009G050100 Sobic009G050100 Sobic006G255800--Sobic009G050100 Sobic001G150800 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Octagon: transcription factors


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