Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G199900.2,Sobic.001G199900.1
Synonym Sb01g017640
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WWC4
Pfam -
Panther DB PTHR31861
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G16530 : Family of unknown function (DUF577)
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g36340.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006384
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G199900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G134500 expressed protein -
2 Sobic.003G037900 ZOS3-23 - C2H2 zinc finger protein, expressed K12848: U4/U6.U5 tri-snRNP component SNU23
3 Sobic.004G307700 cyclin-dependent kinase inhibitor, putative, expressed -
4 Sobic.006G122900 expressed protein K15360: STRA13, CENPX, centromere protein X
5 Sobic.007G222800 RNA recognition motif family protein, expressed K14398: cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6/7
6 Sobic.002G287500 RNA recognition motif containing protein, expressed K13154: U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein
7 Sobic.005G033300 microfibrillar-associated protein 1, putative, expressed K13110: microfibrillar-associated protein 1
8 Sobic.002G228600 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
9 Sobic.005G076650 - -
10 Sobic.002G293900 mitochondrial glycoprotein, putative, expressed -
11 Sobic.006G255800 - -
12 Sobic.004G109500 - -
13 Sobic.008G147101 - -
14 Sobic.003G284500 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22, putative, expressed K15139: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
15 Sobic.004G076850 - -
16 Sobic.002G140900 splicing factor, putative, expressed K12849: pre-mRNA-splicing factor 38A
17 Sobic.004G210101 - -
18 Sobic.007G046400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G245200 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G354700 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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