Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G096401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R8Z7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G067530.3 , HORVU3Hr1G067530.6
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G112900 - -
2 Sobic.009G178800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
3 Sobic.010G143200 - -
4 Sobic.001G191100 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G061400 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G291800 - -
7 Sobic.004G020401 - -
8 Sobic.001G394400 controls maturity(PubMedID : 20585750)@"Regulation of the flowering time, PHYB"(PubMedID : 25961888)@far-red light perception and signal transduction(PubMedID : 14963106)@phytochrome B, putative, expressed K12121: phytochrome B
9 Sobic.003G020100 - -
10 Sobic.009G104300 - -
11 Sobic.006G046000 - -
12 Sobic.009G110366 - -
13 Sobic.004G211400 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@splicing factor, arginine/serine-rich 7, putative, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
14 Sobic.005G007700 expressed protein -
15 Sobic.010G000700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126
16 Sobic.009G022200 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@splicing factor, arginine/serine-rich 7, putative, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
17 Sobic.003G159450 - -
18 Sobic.009G067501 - -
19 Sobic.010G139301 - -
20 Sobic.002G212800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G096401 Sobic007G096401 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic007G096401--Sobic007G112900 Sobic009G178800 Sobic009G178800 Sobic007G096401--Sobic009G178800 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic007G096401--Sobic010G143200 Sobic001G191100 Sobic001G191100 Sobic007G096401--Sobic001G191100 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic007G096401--Sobic002G061400 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic007G096401--Sobic004G291800 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic007G096401--Sobic004G020401 Sobic001G394400 Sobic001G394400 Sobic007G096401--Sobic001G394400 Sobic003G020100 Sobic003G020100 Sobic007G096401--Sobic003G020100 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic007G112900--Sobic002G212800 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic007G112900--Sobic003G159450 Sobic007G112900--Sobic010G143200 Sobic007G112900--Sobic004G291800 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic007G112900--Sobic006G046000 Sobic007G112900--Sobic001G394400 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic007G112900--Sobic008G091671 Sobic008G125600 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Octagon: transcription factors


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