Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G174800.2
Synonym Sb07g024660
Functional annotation carrier, putative, expressed
UniProt C5YND2
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17070 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43980.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030229 , Zm00025a005660 , Zm00025a005656 , Zm00025a005657
Brachypodium PNT68554 , KQJ99310
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G167250 - -
2 Sobic.006G055100 - -
3 Sobic.004G120866 - -
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10 Sobic.010G170800 - -
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12 Sobic.007G216401 - -
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15 Sobic.007G111901 - -
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17 Sobic.003G158100 DUF1399 containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G052450 - -
19 Sobic.009G260800 - -
20 Sobic.005G130500 terpene synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G174800 Sobic007G174800 Sobic006G167250 Sobic006G167250 Sobic007G174800--Sobic006G167250 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic007G174800--Sobic006G055100 Sobic004G120866 Sobic004G120866 Sobic007G174800--Sobic004G120866 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic007G174800--Sobic010G104200 Sobic001G256400 Sobic001G256400 Sobic007G174800--Sobic001G256400 Sobic003G378900 Sobic003G378900 Sobic007G174800--Sobic003G378900 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic007G174800--Sobic001G216900 Sobic002G385200 Sobic002G385200 Sobic007G174800--Sobic002G385200 Sobic002G209500 Sobic002G209500 Sobic007G174800--Sobic002G209500 Sobic005G130500 Sobic005G130500 Sobic006G167250--Sobic005G130500 Sobic006G167250--Sobic010G104200 Sobic008G145400 Sobic008G145400 Sobic006G167250--Sobic008G145400 Sobic008G083600 Sobic008G083600 Sobic006G167250--Sobic008G083600 Sobic006G167250--Sobic004G120866 Sobic006G045800 Sobic006G045800 Sobic006G167250--Sobic006G045800 Sobic006G167250--Sobic006G055100 Sobic005G000400 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Octagon: transcription factors


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