Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G037400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBX1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.008G037400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G050700 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
2 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
3 Sobic.007G072600 OsFBX274 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G056200 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G149300 MMP37-like protein, mitochondrial precursor, putative, expressed K17807: TAM41, mitochondrial translocator assembly and maintenance protein 41
6 Sobic.003G223300 chitinase domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed K17525: chitinase domain-containing protein 1
7 Sobic.007G150500 expressed protein -
8 Sobic.008G147000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CAMK_CAMK_like.49 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2
9 Sobic.001G261250 - -
10 Sobic.002G354800 zinc finger family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G230400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
12 Sobic.001G480550 - -
13 Sobic.003G107000 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
14 Sobic.004G065800 - -
15 Sobic.010G114100 nucleolar complex protein 2, putative, expressed -
16 Sobic.009G034100 peptide chain release factor protein, putative, expressed K02835: prfA, MTRF1, peptide chain release factor 1
17 Sobic.002G357950 - -
18 Sobic.008G156200 zinc finger family protein, putative, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
19 Sobic.010G112700 NHL repeat-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G201601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G037400 Sobic008G037400 Sobic003G050700 Sobic003G050700 Sobic008G037400--Sobic003G050700 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic008G037400--Sobic001G408500 Sobic007G072600 Sobic007G072600 Sobic008G037400--Sobic007G072600 Sobic008G056200 Sobic008G056200 Sobic008G037400--Sobic008G056200 Sobic005G149300 Sobic005G149300 Sobic008G037400--Sobic005G149300 Sobic003G223300 Sobic003G223300 Sobic008G037400--Sobic003G223300 Sobic007G150500 Sobic007G150500 Sobic008G037400--Sobic007G150500 Sobic008G147000 Sobic008G147000 Sobic008G037400--Sobic008G147000 Sobic001G261250 Sobic001G261250 Sobic008G037400--Sobic001G261250 Sobic005G160200 Sobic005G160200 Sobic003G050700--Sobic005G160200 Sobic003G411700 Sobic003G411700 Sobic003G050700--Sobic003G411700 Sobic007G221700 Sobic007G221700 Sobic003G050700--Sobic007G221700 Sobic010G222800 Sobic010G222800 Sobic003G050700--Sobic010G222800 Sobic007G096800 Sobic007G096800 Sobic003G050700--Sobic007G096800 Sobic004G278900 Sobic004G278900 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Octagon: transcription factors


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